101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05650 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_05650  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  435  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1430  transcriptional regulator, MerR family  41.79 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130007  normal  0.485128 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0102  transcriptional regulator  44.5 
 
 		 210 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.246242  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1547  transcriptional regulator, MerR family  46.11 
 
 		 239 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1388  transcriptional regulator, MerR family  38.05 
 
 		 221 aa  134  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2399  transcriptional regulator, MerR family  41.51 
 
 		 209 aa  125  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562399  decreased coverage  0.00011903 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3466  transcriptional regulator, MerR family  39.61 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0193337  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1131  transcriptional regulator, MerR family  45.54 
 
 		 204 aa  118  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349381  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2041  putative transcriptional regulator, MerR family  41.06 
 
 		 213 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0210  putative transcriptional regulator, MerR family  40.3 
 
 		 215 aa  113  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024863  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3179  MerR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 235 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.531372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0017  transcriptional regulator, MerR family  40.2 
 
 		 222 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1748  transcriptional regulator, MerR family  36.74 
 
 		 208 aa  98.2  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2692  regulatory protein, MerR  31.16 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0457116  normal  0.169515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0557  MerR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848982 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2613  transcriptional regulator, MerR family  30.15 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726257 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2904  transcriptional regulator  45.71 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 288 aa  55.1  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 137 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0478  regulatory protein MerR  53.19 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0543  transcriptional regulator, MerR family  33.73 
 
 		 158 aa  49.3  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.166066  hitchhiker  0.000000593111 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0373  transcriptional regulator, MerR family  33.73 
 
 		 158 aa  49.3  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  47.92 
 
 		 144 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1566  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000201032  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 143 aa  48.5  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0137  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 145 aa  48.5  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 131 aa  48.5  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  33.73 
 
 		 303 aa  48.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  41.27 
 
 		 319 aa  48.1  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1494  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  39.13 
 
 		 165 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  46.43 
 
 		 152 aa  47  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 143 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 143 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23510  predicted transcriptional regulator  41.82 
 
 		 138 aa  46.6  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.719058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 249 aa  46.2  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 146 aa  46.2  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  41.1 
 
 		 123 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 144 aa  45.8  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1311  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 243 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3207  putative transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 143 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.789074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 141 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 128 aa  45.4  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  32.22 
 
 		 156 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0211  MerR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 140 aa  45.4  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  46.94 
 
 		 151 aa  45.4  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  46.94 
 
 		 151 aa  45.4  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1596  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 140 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  28.85 
 
 		 141 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 149 aa  44.7  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 140 aa  44.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1199  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 138 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00877844  normal  0.661473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  32.22 
 
 		 156 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1547  MerR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 242 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0186  MerR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0070729  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5802  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 284 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1444  transcriptional regulator, MerR family  33.82 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0102884  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0203  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  26.56 
 
 		 135 aa  43.9  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4426  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 134 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 161 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 141 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 144 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 132 aa  43.5  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  33.8 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1029  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  41.82 
 
 		 161 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352753  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0738  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 160 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.282121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1614  transcriptional regulator, MerR family  35.44 
 
 		 295 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0824  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 300 aa  43.9  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39583  normal  0.651241 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4119  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 137 aa  43.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 142 aa  43.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 144 aa  43.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 146 aa  43.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1798  hypothetical protein  37.8 
 
 		 269 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0231  transcriptional regulator, MerR family  43.4 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 149 aa  42.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2931  MerR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 138 aa  42.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.68732 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 143 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 146 aa  42.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 143 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  38.78 
 
 		 143 aa  42.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  34.25 
 
 		 140 aa  42.7  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  20.3 
 
 		 130 aa  42.4  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  20.3 
 
 		 130 aa  42.4  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 125 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 146 aa  42.4  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  38.78 
 
 		 145 aa  42.4  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4217  MerR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 137 aa  42.4  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1479  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 237 aa  42  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342575  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 139 aa  42  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2008  transcriptional regulator, MerR family  32.91 
 
 		 148 aa  42  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.505788  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 143 aa  41.6  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 137 aa  41.6  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 143 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 143 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1518  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 288 aa  41.6  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545801 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 143 aa  41.6  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3542  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 143 aa  41.6  0.009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 144 aa  41.6  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  31.85 
 
 		 142 aa  41.6  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>