105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0557 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0557  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848982 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2692  regulatory protein, MerR  41.78 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0457116  normal  0.169515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3466  transcriptional regulator, MerR family  38.14 
 
 		 210 aa  121  9e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0193337  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1547  transcriptional regulator, MerR family  37.56 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1430  transcriptional regulator, MerR family  34.38 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130007  normal  0.485128 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3179  MerR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 235 aa  96.3  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.531372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2041  putative transcriptional regulator, MerR family  36.02 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2399  transcriptional regulator, MerR family  37.1 
 
 		 209 aa  95.1  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562399  decreased coverage  0.00011903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1131  transcriptional regulator, MerR family  37.86 
 
 		 204 aa  92.4  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0017  transcriptional regulator, MerR family  36.21 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0102  transcriptional regulator  34.27 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.246242  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0210  putative transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024863  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05650  predicted transcriptional regulator  31.65 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1388  transcriptional regulator, MerR family  26.34 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1748  transcriptional regulator, MerR family  32.55 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2904  transcriptional regulator  41.24 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2613  transcriptional regulator, MerR family  36.89 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  39.47 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  39.71 
 
 		 146 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 146 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  37.68 
 
 		 132 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  30.12 
 
 		 157 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1157  transcriptional regulator, MerR family  37.33 
 
 		 258 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  39.13 
 
 		 145 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 133 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 134 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 150 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 132 aa  49.7  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 132 aa  49.3  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1479  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 237 aa  48.9  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342575  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1547  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 144 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 143 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  43.55 
 
 		 151 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  43.55 
 
 		 151 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  37.65 
 
 		 128 aa  47  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 144 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0231  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3207  putative transcriptional regulator, MerR family  33.03 
 
 		 143 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.789074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  43.14 
 
 		 162 aa  46.6  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 132 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 143 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 132 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0478  regulatory protein MerR  37.84 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  25.85 
 
 		 144 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 143 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 146 aa  45.8  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1311  MerR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  42.11 
 
 		 156 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 147 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 234 aa  45.8  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  37.5 
 
 		 156 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 131 aa  45.1  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 140 aa  45.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 140 aa  45.1  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1444  transcriptional regulator, MerR family  35.62 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0102884  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 137 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1816  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 154 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0245036  normal  0.855302 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0122  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 135 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  29.2 
 
 		 140 aa  45.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  33.82 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 147 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 147 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 144 aa  43.5  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 304 aa  43.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 139 aa  43.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 143 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 143 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 147 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 143 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  36.36 
 
 		 319 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1480  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  26.5 
 
 		 148 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00810919  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4438  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 143 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  34 
 
 		 136 aa  42.7  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2593  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 152 aa  43.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0365897  normal  0.180328 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  34 
 
 		 143 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02024  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  39.22 
 
 		 138 aa  42.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1215  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 152 aa  42.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.460716  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  43.14 
 
 		 152 aa  42.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  34 
 
 		 143 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  35.48 
 
 		 148 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  35.21 
 
 		 148 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 175 aa  42.4  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  30.88 
 
 		 303 aa  42.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 143 aa  42  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  35.48 
 
 		 143 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 143 aa  42  0.008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 143 aa  42  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  35.48 
 
 		 143 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  35.48 
 
 		 143 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 143 aa  42  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 138 aa  42  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  34 
 
 		 160 aa  41.6  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  34 
 
 		 160 aa  41.6  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>