More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1430 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1430  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 210 aa  420  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130007  normal  0.485128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05650  predicted transcriptional regulator  41.79 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0102  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 210 aa  135  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.246242  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0210  putative transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 215 aa  131  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024863  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1547  transcriptional regulator, MerR family  39.18 
 
 		 239 aa  126  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2041  putative transcriptional regulator, MerR family  40.29 
 
 		 213 aa  125  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1131  transcriptional regulator, MerR family  38.54 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349381  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2399  transcriptional regulator, MerR family  36.19 
 
 		 209 aa  99.4  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562399  decreased coverage  0.00011903 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3466  transcriptional regulator, MerR family  32.69 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0193337  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0557  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848982 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1748  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2692  regulatory protein, MerR  35.12 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0457116  normal  0.169515 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3179  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 235 aa  96.3  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.531372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1388  transcriptional regulator, MerR family  28.64 
 
 		 221 aa  92.4  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0017  transcriptional regulator, MerR family  33.48 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2613  transcriptional regulator, MerR family  30.32 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726257 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2904  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  34.44 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_002936  DET1566  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000201032  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0231  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 147 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1798  hypothetical protein  46.91 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1444  transcriptional regulator, MerR family  34.74 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0102884  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1311  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 		 144 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0478  regulatory protein MerR  53.06 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 161 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  40 
 
 		 141 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 151 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 		 151 aa  53.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1547  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 146 aa  53.5  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  47.27 
 
 		 140 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 128 aa  53.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 144 aa  52.4  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 137 aa  52  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 142 aa  52  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 142 aa  52  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  38.36 
 
 		 129 aa  52  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7842  transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 149 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  46 
 
 		 146 aa  52  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 132 aa  52  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 137 aa  51.6  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 143 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1479  MerR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342575  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 146 aa  51.2  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 141 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4119  MerR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 137 aa  51.2  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 143 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  33.75 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  38.81 
 
 		 319 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 140 aa  50.1  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 140 aa  50.1  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  47.06 
 
 		 162 aa  50.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 140 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 149 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  39.71 
 
 		 147 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1816  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 154 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0245036  normal  0.855302 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 134 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  38.36 
 
 		 139 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  41.18 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 133 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 175 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  45.1 
 
 		 156 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 143 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 143 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 139 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  41.18 
 
 		 143 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1129  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 131 aa  50.1  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.560457  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 143 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  41.18 
 
 		 143 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 143 aa  49.7  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  41.18 
 
 		 143 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  45.1 
 
 		 156 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  39.19 
 
 		 125 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  42 
 
 		 144 aa  49.7  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 138 aa  49.3  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 143 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  37.14 
 
 		 141 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 140 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  41.18 
 
 		 143 aa  49.3  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  38 
 
 		 144 aa  49.3  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3410  hypothetical protein  38.57 
 
 		 142 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2300  MerR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 134 aa  48.9  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.639917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0442  transcriptional regulator, MerR family  35.65 
 
 		 132 aa  48.9  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  36 
 
 		 143 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  36 
 
 		 143 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 146 aa  48.5  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>