85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3230 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 249 aa  498  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1596  transcriptional regulator, MerR family  33.04 
 
 		 237 aa  96.7  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1547  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0186  MerR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 250 aa  88.6  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0070729  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1479  MerR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1566  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000201032  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1444  transcriptional regulator, MerR family  25.32 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0102884  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1311  MerR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2071  MerR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.776641  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2692  regulatory protein, MerR  44.78 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0457116  normal  0.169515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0557  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848982 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1430  transcriptional regulator, MerR family  34.44 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130007  normal  0.485128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1547  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2613  transcriptional regulator, MerR family  32.73 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3466  transcriptional regulator, MerR family  38.36 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0193337  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1157  transcriptional regulator, MerR family  42.35 
 
 		 258 aa  52  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  33.72 
 
 		 143 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0210  putative transcriptional regulator, MerR family  34.33 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024863  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  35.48 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1131  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 		 204 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349381  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5121  transcriptional regulator, MerR family  39.44 
 
 		 242 aa  50.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  36.49 
 
 		 319 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4750  transcriptional regulator, MerR family  37.33 
 
 		 243 aa  49.7  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  29.17 
 
 		 258 aa  49.3  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3723  MerR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3650  MerR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0795396  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 135 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0231  transcriptional regulator, MerR family  37.66 
 
 		 250 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1388  transcriptional regulator, MerR family  30.88 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1748  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 122 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3663  MerR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.532115 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0776  regulatory protein MerR  38.24 
 
 		 272 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2904  transcriptional regulator  34.09 
 
 		 207 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 137 aa  47  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  33.05 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  33.1 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1614  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 295 aa  46.6  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05650  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 		 217 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0419  MerR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 146 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000107138  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4271  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 262 aa  45.8  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194258  normal  0.647019 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2041  putative transcriptional regulator, MerR family  34.25 
 
 		 213 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  39.13 
 
 		 145 aa  45.4  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  33.05 
 
 		 319 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5802  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 284 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1437  MerR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 390 aa  43.9  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3819  regulatory protein MerR  37.74 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.977775  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 144 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 135 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 129 aa  43.5  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  25.74 
 
 		 135 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  32 
 
 		 139 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 135 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5166  MerR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 135 aa  43.5  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5053  MerR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 135 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 135 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6980  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 299 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 135 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 144 aa  43.5  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0189  MerR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528069  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  25.74 
 
 		 135 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5456  transcriptional regulator, MerR family  25.74 
 
 		 135 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  30.65 
 
 		 237 aa  42.7  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0149  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 248 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 135 aa  42.4  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 135 aa  42.4  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  32.08 
 
 		 129 aa  42.7  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  30.95 
 
 		 133 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  37.33 
 
 		 288 aa  42.7  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 135 aa  42  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 135 aa  42  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  33.78 
 
 		 253 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 135 aa  42  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 135 aa  42  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 135 aa  42  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 146 aa  42.4  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 135 aa  42  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 135 aa  42  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1773  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 142 aa  42  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1922  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 155 aa  42  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>