260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3819 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3819  regulatory protein MerR  100 
 
 		 297 aa  577  1e-164  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.977775  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4902  MerR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 287 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337456  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1518  MerR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 288 aa  151  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545801 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0149  transcriptional regulator, MerR family  35.86 
 
 		 248 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0462  transcriptional regulator, MerR family  40.74 
 
 		 264 aa  122  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1798  hypothetical protein  33.33 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2333  MerR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 253 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3330  MerR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 272 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0993383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21070  MerR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 232 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.471821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4344  regulatory protein MerR  35.63 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1302  MerR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1351  MerR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0327248  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0555  MerR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119185  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1013  MerR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106241  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0285  MerR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.184763  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2529  MerR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1468  MerR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1273  MerR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0231  transcriptional regulator, MerR family  37.21 
 
 		 250 aa  105  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3602  MerR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 293 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4881  transcriptional regulator, MerR family  31.36 
 
 		 288 aa  102  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458694  normal  0.771198 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3016  transcriptional regulator, MerR family  30.34 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3080  transcription regulator protein  31.28 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.730873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5630  MerR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 282 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122388  normal  0.561699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3698  MerR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 282 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4670  MerR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 282 aa  99.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2531  MerR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 246 aa  99.8  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.410302  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4126  MerR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 261 aa  99.8  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3363  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 272 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.65953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4022  MerR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 279 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28056  normal  0.857059 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1153  MerR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 279 aa  98.2  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0304735  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1788  MerR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3650  MerR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 259 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0795396  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3723  MerR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 259 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3663  MerR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 259 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.532115 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4518  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 282 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584937  normal  0.575813 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4060  MerR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 282 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00710658  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3512  transcriptional regulator, MerR family  48.42 
 
 		 251 aa  88.6  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0776  regulatory protein MerR  49.4 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4750  transcriptional regulator, MerR family  36.02 
 
 		 243 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5121  transcriptional regulator, MerR family  38.17 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0820  MerR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 131 aa  67.4  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.575513  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0770  MerR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 151 aa  67  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.744449  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5802  transcriptional regulator, MerR family  37.35 
 
 		 284 aa  60.8  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4036  MerR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1157  transcriptional regulator, MerR family  45.9 
 
 		 258 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2472  regulatory protein, MerR  33.07 
 
 		 130 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0886191 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  34.55 
 
 		 146 aa  53.9  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 146 aa  53.9  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001544  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  33.65 
 
 		 124 aa  53.1  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3653  MerR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 133 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2733  MerR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 135 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2743  transcriptional regulator, MerR family  32.28 
 
 		 130 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785681  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 142 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1311  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 132 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  40.48 
 
 		 156 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  39.29 
 
 		 159 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3063  MerR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 142 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.858131  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  31.09 
 
 		 283 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21300  putative transcriptional regulator, MerR family  35.48 
 
 		 126 aa  50.4  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.282314  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2071  MerR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 177 aa  50.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.776641  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2120  MerR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 147 aa  49.7  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00663209  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05481  hypothetical protein  32.53 
 
 		 127 aa  49.7  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  39.29 
 
 		 176 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  39.29 
 
 		 171 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 135 aa  49.7  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  39.29 
 
 		 176 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  39.29 
 
 		 171 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  39.29 
 
 		 157 aa  49.7  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1808  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 131 aa  49.3  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306071  normal  0.126025 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  39.02 
 
 		 148 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3791  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 149 aa  49.3  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  39.29 
 
 		 163 aa  49.3  0.00009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 297 aa  48.9  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  31.88 
 
 		 143 aa  48.9  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 135 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 135 aa  48.9  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  39.73 
 
 		 148 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4271  transcriptional regulator, MerR family  25.88 
 
 		 262 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194258  normal  0.647019 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 135 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 135 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 135 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 135 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 135 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 135 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 135 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38430  regulatory gene of gnyRDBHAL cluster, GnyR  35.23 
 
 		 134 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  43.08 
 
 		 133 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 135 aa  48.9  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 135 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 135 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1351  transcriptional regulator MerR family CueR domain protein  39.71 
 
 		 142 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  41.27 
 
 		 155 aa  48.1  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 137 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  37.93 
 
 		 173 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  36.9 
 
 		 157 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  36.9 
 
 		 157 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1805  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 150 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.589257  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49570  transcriptional regulatory protein, MerR family  41.1 
 
 		 133 aa  47.8  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0397848  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  36.62 
 
 		 136 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>