229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1805 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1805  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 150 aa  311  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.589257  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2128  transcriptional regulator, MerR family  40.94 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1709  transcriptional regulator, MerR family  40.94 
 
 		 159 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2071  MerR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.776641  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  36.99 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0803  HTH-type transcriptional regulator CueR (copper export regulator)  40.28 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5121  transcriptional regulator, MerR family  38.36 
 
 		 242 aa  54.3  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1032  transcriptional regulator, MerR family  36.99 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.920994  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3026  transcriptional regulator, MerR family  34.72 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1013  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 285 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106241  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1351  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 285 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0327248  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2529  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 285 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2382  putative transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 213 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123415  hitchhiker  0.000694345 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1273  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 285 aa  50.4  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0555  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 285 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119185  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0285  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 285 aa  50.4  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.184763  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 132 aa  50.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1302  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 268 aa  50.4  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5802  transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 284 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1153  MerR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 279 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0304735  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5630  MerR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 282 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122388  normal  0.561699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3698  MerR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 282 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4060  MerR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 282 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00710658  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4022  MerR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 279 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28056  normal  0.857059 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4670  MerR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 282 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4518  MerR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 282 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584937  normal  0.575813 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  39.73 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01412  Transcriptional regulator MerR  43.24 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.536111  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  36.62 
 
 		 247 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0220  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0495  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292362  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1468  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 285 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1103  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1117  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2902  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1604  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2912  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0392  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0882  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.656142 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02950  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  39.44 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0289893  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001544  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  39.53 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4002  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0894  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0470  putative transcriptional regulator, MerR family  41.89 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0194  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  35.21 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1788  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 297 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131469 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3819  regulatory protein MerR  36.23 
 
 		 297 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.977775  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4881  transcriptional regulator, MerR family  32.43 
 
 		 288 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458694  normal  0.771198 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3218  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  36.11 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  28.89 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1098  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  36.49 
 
 		 143 aa  47.4  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2682  putative regulatory protein  39.19 
 
 		 172 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.537318  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00438  DNA-binding transcriptional activator of copper-responsive regulon genes  31.51 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3123  transcriptional regulator, MerR family  31.51 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.856714  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0422  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.51 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3129  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.51 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.943376  hitchhiker  0.0000753695 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0586  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.51 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.775911 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0382  transcriptional regulator, MerR family  32.14 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4461  putative transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 258 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  35.21 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00443  hypothetical protein  31.51 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0566  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.51 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3492  transcriptional regulator, MerR family protein  35.06 
 
 		 135 aa  47  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0526  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.51 
 
 		 135 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0530  DNA-binding transcriptional regulator CueR  31.51 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  35.21 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2779  MerR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 180 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 128 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38430  regulatory gene of gnyRDBHAL cluster, GnyR  32.98 
 
 		 134 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0231  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 250 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  35.9 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06131  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  29.76 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1311  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0776  regulatory protein MerR  36.62 
 
 		 272 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49570  transcriptional regulatory protein, MerR family  31.91 
 
 		 133 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0397848  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2558  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 154 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0004  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 169 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 297 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 136 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  33.33 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  33.33 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  33.33 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  33.8 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  33.33 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 133 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  34.72 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>