245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0776 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0776  regulatory protein MerR  100 
 
 		 272 aa  554  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0149  transcriptional regulator, MerR family  36.71 
 
 		 248 aa  150  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0462  transcriptional regulator, MerR family  36.95 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1798  hypothetical protein  37.87 
 
 		 269 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3080  transcription regulator protein  34.94 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.730873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2333  MerR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 253 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2529  MerR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0285  MerR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.184763  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0555  MerR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1351  MerR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0327248  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1273  MerR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1013  MerR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106241  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1302  MerR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4881  transcriptional regulator, MerR family  36.17 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458694  normal  0.771198 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1788  MerR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 297 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131469 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4022  MerR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 279 aa  125  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28056  normal  0.857059 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1468  MerR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 285 aa  125  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21070  MerR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 232 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.471821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3330  MerR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0993383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3602  MerR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5630  MerR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122388  normal  0.561699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3698  MerR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4670  MerR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1153  MerR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0304735  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3363  transcriptional regulator, MerR family  34.62 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.65953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3016  transcriptional regulator, MerR family  34.19 
 
 		 272 aa  116  3e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0231  transcriptional regulator, MerR family  31.6 
 
 		 250 aa  115  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4518  MerR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 282 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584937  normal  0.575813 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4060  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 282 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00710658  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4344  regulatory protein MerR  31.17 
 
 		 264 aa  106  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4902  MerR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 287 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337456  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1518  MerR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 288 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545801 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5121  transcriptional regulator, MerR family  32.26 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4750  transcriptional regulator, MerR family  27.24 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4271  transcriptional regulator, MerR family  26.32 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194258  normal  0.647019 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3819  regulatory protein MerR  49.4 
 
 		 297 aa  82.4  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.977775  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3650  MerR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0795396  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3723  MerR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3663  MerR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.532115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2531  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 246 aa  79  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.410302  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4126  MerR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 261 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3512  transcriptional regulator, MerR family  50.72 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1157  transcriptional regulator, MerR family  50.75 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5802  transcriptional regulator, MerR family  25.54 
 
 		 284 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2071  MerR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 177 aa  57  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.776641  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000328  HTH-type transcriptional regulator CueR  38.57 
 
 		 128 aa  57.4  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000737909  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  42.47 
 
 		 129 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 		 155 aa  53.1  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06131  Zn(II)-responsive regulator of ZntA  35.71 
 
 		 128 aa  52.8  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  38.55 
 
 		 167 aa  52.4  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 143 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 138 aa  52  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 153 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  36.96 
 
 		 129 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 131 aa  50.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5990  mercury resistance regulatory protein MerR  43.48 
 
 		 132 aa  49.3  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.479863 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 135 aa  49.3  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  38.2 
 
 		 319 aa  49.3  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2120  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 147 aa  49.3  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00663209  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 132 aa  48.9  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 173 aa  48.9  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  42.65 
 
 		 157 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4277  MerR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 140 aa  48.9  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  42.65 
 
 		 163 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  33.73 
 
 		 92 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 215 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 132 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000376  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  34.57 
 
 		 128 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1943  transcriptional regulator of MerR family protein  39.71 
 
 		 135 aa  48.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.555422  normal  0.0105773 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4117  MerR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 140 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  38.24 
 
 		 130 aa  47.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  38.24 
 
 		 130 aa  47.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05481  hypothetical protein  35.71 
 
 		 127 aa  48.1  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  41.18 
 
 		 156 aa  47.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 		 133 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 		 129 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2617  transcriptional regulator MerR family  40 
 
 		 130 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874214  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  46.03 
 
 		 140 aa  47.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 142 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  41.18 
 
 		 157 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 142 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  33.05 
 
 		 133 aa  47.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21300  putative transcriptional regulator, MerR family  39.34 
 
 		 126 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.282314  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001544  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  35.71 
 
 		 124 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  36.05 
 
 		 215 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  36.05 
 
 		 214 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 304 aa  47  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  37.31 
 
 		 129 aa  47  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 138 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  41.18 
 
 		 157 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 98 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  32.43 
 
 		 131 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2851  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 135 aa  46.6  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3791  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 149 aa  46.6  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  41.18 
 
 		 176 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 137 aa  46.6  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  37.31 
 
 		 129 aa  47  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2796  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 132 aa  46.6  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  41.18 
 
 		 171 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>