117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4902 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4902  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 287 aa  570  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337456  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1518  MerR family transcriptional regulator  85.42 
 
 		 288 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0462  transcriptional regulator, MerR family  36.75 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1468  MerR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2529  MerR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0285  MerR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.184763  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0555  MerR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1351  MerR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0327248  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1273  MerR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1013  MerR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 285 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106241  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1302  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 268 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1798  hypothetical protein  34.51 
 
 		 269 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3330  MerR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 272 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0993383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3819  regulatory protein MerR  38.91 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.977775  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2333  MerR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4022  MerR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28056  normal  0.857059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0149  transcriptional regulator, MerR family  35.15 
 
 		 248 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3698  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4670  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5630  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 282 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122388  normal  0.561699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4881  transcriptional regulator, MerR family  33.85 
 
 		 288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458694  normal  0.771198 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1788  MerR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0231  transcriptional regulator, MerR family  33.62 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1153  MerR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 279 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0304735  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4344  regulatory protein MerR  33.88 
 
 		 264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21070  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.471821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3602  MerR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3080  transcription regulator protein  33.33 
 
 		 256 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.730873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3363  transcriptional regulator, MerR family  34.54 
 
 		 272 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.65953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3016  transcriptional regulator, MerR family  34.54 
 
 		 272 aa  123  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4518  MerR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 282 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584937  normal  0.575813 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4060  MerR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00710658  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4126  MerR family transcriptional regulator  53.41 
 
 		 261 aa  106  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2531  MerR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 246 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.410302  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3663  MerR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 259 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.532115 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3650  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0795396  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3723  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0776  regulatory protein MerR  29.79 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3512  transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4750  transcriptional regulator, MerR family  31.51 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4271  transcriptional regulator, MerR family  26.07 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194258  normal  0.647019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5802  transcriptional regulator, MerR family  39.24 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1157  transcriptional regulator, MerR family  30.41 
 
 		 258 aa  67  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5121  transcriptional regulator, MerR family  42.03 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0770  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 151 aa  57.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.744449  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0820  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.575513  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 98 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2120  MerR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 147 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00663209  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  38.03 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 143 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001544  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  31.25 
 
 		 124 aa  50.8  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4036  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 155 aa  48.9  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05481  hypothetical protein  30.77 
 
 		 127 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  32.14 
 
 		 92 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1430  transcriptional regulator, MerR family  34.55 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130007  normal  0.485128 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1094  MerR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 159 aa  47  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000376  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  37.14 
 
 		 128 aa  47  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2029  transcriptional regulator, MerR family  31.88 
 
 		 298 aa  46.6  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 136 aa  46.6  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  33.08 
 
 		 155 aa  46.6  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2071  MerR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 177 aa  45.8  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.776641  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000328  HTH-type transcriptional regulator CueR  29.03 
 
 		 128 aa  46.2  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000737909  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2788  MerR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 127 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3791  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 149 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2967  MerR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 127 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2526  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 115 aa  45.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.120952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1808  transcriptional regulator, MerR family  35.62 
 
 		 131 aa  45.4  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306071  normal  0.126025 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 150 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  38 
 
 		 135 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1604  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 132 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408044  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  38 
 
 		 135 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5053  MerR family transcriptional regulator  38 
 
 		 135 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  38 
 
 		 135 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  38 
 
 		 135 aa  44.3  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1363  MerR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 134 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.381305 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3886  MerR family transcriptional regulator  38 
 
 		 135 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 136 aa  44.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5166  MerR family transcriptional regulator  38 
 
 		 135 aa  44.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3222  MerR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 132 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.012049 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  38 
 
 		 135 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5494  transcriptional regulator, MerR family  38 
 
 		 135 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5456  transcriptional regulator, MerR family  38 
 
 		 135 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  38 
 
 		 135 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  31.65 
 
 		 157 aa  44.7  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1898  transcriptional regulator, putative  31.87 
 
 		 134 aa  43.9  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2472  regulatory protein, MerR  35.63 
 
 		 130 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0886191 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2321  MerR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 134 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2393  MerR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 134 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1673  MerR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 134 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0004  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  43.9  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0461  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 174 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0313707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2796  MerR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 132 aa  43.9  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21300  putative transcriptional regulator, MerR family  35.59 
 
 		 126 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.282314  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2068  transcriptional regulator, MerR family  36.49 
 
 		 128 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 133 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2827  MerR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 135 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2845  MerR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 135 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>