150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1518 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1518  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 288 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4902  MerR family transcriptional regulator  85.42 
 
 		 287 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337456  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1798  hypothetical protein  37.45 
 
 		 269 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2333  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 253 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3330  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 272 aa  146  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0993383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0149  transcriptional regulator, MerR family  36.61 
 
 		 248 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0462  transcriptional regulator, MerR family  35.32 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3363  transcriptional regulator, MerR family  35.27 
 
 		 272 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.65953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3016  transcriptional regulator, MerR family  35.66 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4344  regulatory protein MerR  33.47 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3080  transcription regulator protein  35.22 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.730873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3819  regulatory protein MerR  38.4 
 
 		 297 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.977775  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3602  MerR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 293 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2529  MerR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1468  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 285 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0285  MerR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.184763  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0555  MerR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1351  MerR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0327248  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1273  MerR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1013  MerR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106241  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1302  MerR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 268 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1788  MerR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131469 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4022  MerR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28056  normal  0.857059 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4881  transcriptional regulator, MerR family  31.87 
 
 		 288 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458694  normal  0.771198 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21070  MerR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.471821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0231  transcriptional regulator, MerR family  33.05 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1153  MerR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 279 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0304735  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5630  MerR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 282 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122388  normal  0.561699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3698  MerR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 282 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4670  MerR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 282 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4060  MerR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 282 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00710658  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4518  MerR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584937  normal  0.575813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4126  MerR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 261 aa  108  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2531  MerR family transcriptional regulator  52.13 
 
 		 246 aa  105  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.410302  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3512  transcriptional regulator, MerR family  33.82 
 
 		 251 aa  102  9e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3650  MerR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 259 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0795396  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3723  MerR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 259 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3663  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 259 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.532115 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0776  regulatory protein MerR  28.39 
 
 		 272 aa  93.2  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4750  transcriptional regulator, MerR family  28.22 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1157  transcriptional regulator, MerR family  30.82 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5802  transcriptional regulator, MerR family  37.97 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5121  transcriptional regulator, MerR family  42.05 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4271  transcriptional regulator, MerR family  24.4 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194258  normal  0.647019 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0820  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.575513  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0770  MerR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.744449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  38.03 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001544  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  30.21 
 
 		 124 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05481  hypothetical protein  31.87 
 
 		 127 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 98 aa  50.4  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2120  MerR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 147 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00663209  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4036  MerR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 155 aa  50.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 143 aa  49.3  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2029  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 298 aa  49.3  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 297 aa  48.9  0.00009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1430  transcriptional regulator, MerR family  37.78 
 
 		 210 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130007  normal  0.485128 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2640  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 		 283 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21300  putative transcriptional regulator, MerR family  40.68 
 
 		 126 aa  47  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.282314  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2071  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 177 aa  46.6  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.776641  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000328  HTH-type transcriptional regulator CueR  29.23 
 
 		 128 aa  46.6  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000737909  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 288 aa  46.6  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3222  MerR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 132 aa  46.6  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.012049 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3843  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 154 aa  45.8  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 136 aa  46.2  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3791  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 149 aa  45.8  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5166  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  46.2  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5456  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 135 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5053  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  45.8  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  45.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000376  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  35.71 
 
 		 128 aa  45.8  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  34.25 
 
 		 92 aa  45.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 135 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 135 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0133  MerR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 151 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1034  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 128 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0151455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3886  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 135 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5494  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 135 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1179  transcriptional regulator, putative  31.06 
 
 		 128 aa  44.3  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0654796  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1865  transcriptional regulator, MerR family  36.49 
 
 		 128 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.0420495 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  34.85 
 
 		 133 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0102  MerR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 144 aa  44.3  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1599  MerR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 131 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1138  putative transcriptional regulator  31.06 
 
 		 128 aa  44.3  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0775517  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 153 aa  44.3  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2068  transcriptional regulator, MerR family  36.49 
 
 		 128 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1604  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 132 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408044  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 215 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1673  MerR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 134 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1363  MerR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 134 aa  43.9  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.381305 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2827  MerR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 135 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1720  MerR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 134 aa  43.9  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  31.65 
 
 		 157 aa  43.9  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 		 128 aa  43.9  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3063  MerR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 142 aa  43.9  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.858131  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1459  MerR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 132 aa  43.9  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.425414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 136 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2972  MerR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 135 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.54764  normal  0.504684 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>