More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1157 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1157  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 258 aa  501  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4750  transcriptional regulator, MerR family  37.55 
 
 		 243 aa  135  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4271  transcriptional regulator, MerR family  33.91 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194258  normal  0.647019 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0149  transcriptional regulator, MerR family  39.36 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3602  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 293 aa  98.6  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3080  transcription regulator protein  31.91 
 
 		 256 aa  97.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.730873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2333  MerR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5121  transcriptional regulator, MerR family  32.2 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3330  MerR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 272 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0993383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3363  transcriptional regulator, MerR family  31.2 
 
 		 272 aa  96.3  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.65953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3016  transcriptional regulator, MerR family  31.2 
 
 		 272 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1798  hypothetical protein  36.16 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0462  transcriptional regulator, MerR family  31.86 
 
 		 264 aa  87  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1273  MerR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1351  MerR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0327248  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2529  MerR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0555  MerR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119185  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1468  MerR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0285  MerR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.184763  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1013  MerR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 285 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106241  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1302  MerR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0231  transcriptional regulator, MerR family  30.6 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1788  MerR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131469 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4881  transcriptional regulator, MerR family  28.76 
 
 		 288 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458694  normal  0.771198 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4022  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28056  normal  0.857059 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5630  MerR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122388  normal  0.561699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3698  MerR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4670  MerR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5802  transcriptional regulator, MerR family  29.64 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0776  regulatory protein MerR  50.75 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21070  MerR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.471821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1153  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0304735  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4518  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584937  normal  0.575813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1518  MerR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 288 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545801 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4060  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 282 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00710658  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3723  MerR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3650  MerR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0795396  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4902  MerR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 287 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337456  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 150 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3663  MerR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.532115 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4344  regulatory protein MerR  40.66 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2531  MerR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.410302  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  48.53 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  42.05 
 
 		 152 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4126  MerR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3512  transcriptional regulator, MerR family  35.51 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  46.15 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2071  MerR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.776641  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  44.62 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 131 aa  58.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0824  MerR family transcriptional regulator  48.61 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39583  normal  0.651241 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2967  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  35.19 
 
 		 156 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0340992  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  41.18 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  46.07 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  46.38 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  46.58 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2489  putative transcriptional regulator, MerR family  37.35 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633728 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  47.22 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35170  putative redox-sensing activator of soxS  35.19 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4538  transcriptional activator for superoxide response; Fe-S center for redox-sensing (MerR family)  37.36 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.485722  normal  0.455986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4461  putative transcriptional regulator, MerR family  47.06 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3920  MerR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 152 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.692968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3819  regulatory protein MerR  45.9 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.977775  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 188 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2125  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.47 
 
 		 150 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0226644  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1053  MerR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 173 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  45.21 
 
 		 133 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 166 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 138 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3972  MerR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 149 aa  54.3  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  40.85 
 
 		 319 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 171 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  42.86 
 
 		 129 aa  54.3  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 166 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1366  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 166 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0373128  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1856  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 166 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424581  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 		 183 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 161 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2377  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 166 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2129  MerR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 150 aa  53.5  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.802398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 160 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 160 aa  53.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3642  transcriptional regulator, MerR family  32.41 
 
 		 158 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 166 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0041  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 166 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21109  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5097  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 303 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0313452 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2733  MerR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 135 aa  53.5  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2211  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 166 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1127  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 166 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0247655  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 166 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  45.31 
 
 		 150 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1741  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 166 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0950545  normal  0.107699 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  43.08 
 
 		 139 aa  53.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  43.82 
 
 		 141 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2216  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 166 aa  53.1  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.741024  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3141  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  37.78 
 
 		 159 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.814433  normal  0.503062 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1768  MerR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 166 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>