188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1153 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1153  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 279 aa  558  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0304735  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3698  MerR family transcriptional regulator  95.7 
 
 		 282 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4670  MerR family transcriptional regulator  95.7 
 
 		 282 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5630  MerR family transcriptional regulator  95.34 
 
 		 282 aa  526  1e-148  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122388  normal  0.561699 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4022  MerR family transcriptional regulator  91.39 
 
 		 279 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28056  normal  0.857059 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4518  MerR family transcriptional regulator  91.61 
 
 		 282 aa  485  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584937  normal  0.575813 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4060  MerR family transcriptional regulator  92.34 
 
 		 282 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00710658  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2529  MerR family transcriptional regulator  80.74 
 
 		 285 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1468  MerR family transcriptional regulator  81.27 
 
 		 285 aa  441  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0285  MerR family transcriptional regulator  80.74 
 
 		 285 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.184763  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0555  MerR family transcriptional regulator  80.74 
 
 		 285 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1351  MerR family transcriptional regulator  80.74 
 
 		 285 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0327248  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1273  MerR family transcriptional regulator  80.74 
 
 		 285 aa  443  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1013  MerR family transcriptional regulator  80.74 
 
 		 285 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106241  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1302  MerR family transcriptional regulator  84.06 
 
 		 268 aa  433  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1788  MerR family transcriptional regulator  68.42 
 
 		 297 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131469 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4881  transcriptional regulator, MerR family  70.12 
 
 		 288 aa  355  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458694  normal  0.771198 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3080  transcription regulator protein  60.83 
 
 		 256 aa  291  9e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.730873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3363  transcriptional regulator, MerR family  60.39 
 
 		 272 aa  289  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.65953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3016  transcriptional regulator, MerR family  61.38 
 
 		 272 aa  287  1e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3602  MerR family transcriptional regulator  53.36 
 
 		 293 aa  279  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1798  hypothetical protein  43.2 
 
 		 269 aa  185  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0462  transcriptional regulator, MerR family  40.08 
 
 		 264 aa  176  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2333  MerR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 253 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3330  MerR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 272 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0993383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0149  transcriptional regulator, MerR family  43.44 
 
 		 248 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21070  MerR family transcriptional regulator  42.29 
 
 		 232 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.471821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1518  MerR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4902  MerR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337456  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0231  transcriptional regulator, MerR family  36.89 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0776  regulatory protein MerR  33.91 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4344  regulatory protein MerR  44.19 
 
 		 264 aa  116  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4750  transcriptional regulator, MerR family  35.65 
 
 		 243 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5121  transcriptional regulator, MerR family  34.93 
 
 		 242 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3819  regulatory protein MerR  33.68 
 
 		 297 aa  96.7  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.977775  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4271  transcriptional regulator, MerR family  30.49 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194258  normal  0.647019 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3663  MerR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.532115 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3650  MerR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 259 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0795396  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3723  MerR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 259 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2531  MerR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.410302  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4126  MerR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5802  transcriptional regulator, MerR family  34.57 
 
 		 284 aa  85.1  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3512  transcriptional regulator, MerR family  55.22 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1157  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1094  MerR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 159 aa  55.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  40.58 
 
 		 151 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  34.12 
 
 		 92 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 151 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000376  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  37.5 
 
 		 128 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1805  MerR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 150 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.589257  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2120  MerR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 147 aa  49.7  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00663209  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 135 aa  48.9  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05481  hypothetical protein  29.03 
 
 		 127 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38430  regulatory gene of gnyRDBHAL cluster, GnyR  37.14 
 
 		 134 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 136 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2788  MerR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 127 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.291885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0181  MerR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 144 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.911706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2967  MerR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 127 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3653  MerR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 133 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4252  MerR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 134 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.285942  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001544  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  31.4 
 
 		 124 aa  47.4  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2071  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 177 aa  47.4  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.776641  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0464  transcriptional regulator, MerR family  37.97 
 
 		 134 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2796  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 132 aa  47.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 143 aa  47  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2743  transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 130 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785681  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2472  regulatory protein, MerR  34.78 
 
 		 130 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0886191 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0238  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 141 aa  47  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3273  regulatory protein GnyR  37.14 
 
 		 134 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2034  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 128 aa  47  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327556  normal  0.554633 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 186 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  33.85 
 
 		 252 aa  46.6  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2322  transcriptional regulator, MerR family  32.39 
 
 		 129 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 132 aa  46.6  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49570  transcriptional regulatory protein, MerR family  35.44 
 
 		 133 aa  46.2  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0397848  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2321  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 134 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2393  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 134 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0004  MerR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 169 aa  46.2  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4309  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 144 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1673  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 134 aa  46.2  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1898  transcriptional regulator, putative  34.29 
 
 		 134 aa  45.8  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3222  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 132 aa  46.2  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.012049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2029  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 298 aa  45.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1363  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 134 aa  45.8  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.381305 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2733  MerR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 135 aa  45.8  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  29.01 
 
 		 144 aa  45.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  36.62 
 
 		 133 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3063  MerR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 142 aa  45.8  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.858131  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2972  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 135 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.54764  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1531  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 135 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2845  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 135 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2827  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 135 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1720  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 134 aa  45.8  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  38.81 
 
 		 167 aa  45.8  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1459  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 132 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.425414 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0102  MerR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 144 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2726  transcriptional regulator, MerR family protein  31.03 
 
 		 136 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505695  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  30.49 
 
 		 183 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 137 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2569  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 133 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>