57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2531 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2531  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
246 aa  486  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.410302  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4126  MerR family transcriptional regulator  72.76 
 
 
261 aa  358  4e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3663  MerR family transcriptional regulator  51.01 
 
 
259 aa  224  7e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.532115 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3723  MerR family transcriptional regulator  50.61 
 
 
259 aa  221  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3650  MerR family transcriptional regulator  50.61 
 
 
259 aa  221  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0795396  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1518  MerR family transcriptional regulator  52.13 
 
 
288 aa  105  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.545801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4902  MerR family transcriptional regulator  51.06 
 
 
287 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337456  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3819  regulatory protein MerR  39.53 
 
 
297 aa  99.4  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.977775  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4344  regulatory protein MerR  48.86 
 
 
264 aa  97.4  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1798  hypothetical protein  32.76 
 
 
269 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0462  transcriptional regulator, MerR family  48.86 
 
 
264 aa  94.4  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2333  MerR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
253 aa  92.4  5e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0149  transcriptional regulator, MerR family  46.32 
 
 
248 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1468  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
285 aa  89.7  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1013  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
285 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106241  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1273  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
285 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1351  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
285 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0327248  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0555  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
285 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119185  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0285  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
285 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.184763  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2529  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
285 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1302  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
268 aa  89.4  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3602  MerR family transcriptional regulator  44.33 
 
 
293 aa  89  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4518  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 
282 aa  89  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584937  normal  0.575813 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3512  transcriptional regulator, MerR family  34.62 
 
 
251 aa  88.6  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4670  MerR family transcriptional regulator  44.09 
 
 
282 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1153  MerR family transcriptional regulator  44.09 
 
 
279 aa  88.2  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0304735  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3363  transcriptional regulator, MerR family  41.24 
 
 
272 aa  87.8  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.65953  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3330  MerR family transcriptional regulator  47.73 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0993383  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3698  MerR family transcriptional regulator  44.09 
 
 
282 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4022  MerR family transcriptional regulator  42.71 
 
 
279 aa  87.8  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28056  normal  0.857059 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4060  MerR family transcriptional regulator  44.09 
 
 
282 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00710658  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3016  transcriptional regulator, MerR family  41.24 
 
 
272 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4881  transcriptional regulator, MerR family  33.13 
 
 
288 aa  87  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458694  normal  0.771198 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5630  MerR family transcriptional regulator  44.09 
 
 
282 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122388  normal  0.561699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1788  MerR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
297 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000131469 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3080  transcription regulator protein  39.39 
 
 
256 aa  85.9  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.730873  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21070  MerR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
232 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.471821  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0776  regulatory protein MerR  50 
 
 
272 aa  79  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0231  transcriptional regulator, MerR family  44.71 
 
 
250 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1157  transcriptional regulator, MerR family  31.06 
 
 
258 aa  62.4  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5802  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 
284 aa  62  0.000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5121  transcriptional regulator, MerR family  38.64 
 
 
242 aa  58.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4750  transcriptional regulator, MerR family  34.55 
 
 
243 aa  52.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
297 aa  48.9  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1868  transcriptional regulator, MerR family  34.57 
 
 
247 aa  46.6  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  34.02 
 
 
123 aa  45.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
288 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  38.81 
 
 
92 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1805  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
150 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.589257  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2029  transcriptional regulator, MerR family  26.13 
 
 
298 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0085  MerR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
117 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1098  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 
134 aa  42.7  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3791  MerR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
149 aa  42.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4271  transcriptional regulator, MerR family  25.41 
 
 
262 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194258  normal  0.647019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0082  MerR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
117 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0086  MerR family transcriptional regulator  32.88 
 
 
117 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
98 aa  42  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>