209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5121 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5121  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 242 aa  484  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4750  transcriptional regulator, MerR family  39.64 
 
 		 243 aa  151  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4271  transcriptional regulator, MerR family  36.73 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194258  normal  0.647019 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0149  transcriptional regulator, MerR family  36.4 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0462  transcriptional regulator, MerR family  35.51 
 
 		 264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3602  MerR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 293 aa  112  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2333  MerR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 253 aa  109  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1788  MerR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 297 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131469 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4022  MerR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 279 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28056  normal  0.857059 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1153  MerR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0304735  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3363  transcriptional regulator, MerR family  33.75 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.65953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3016  transcriptional regulator, MerR family  33.75 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3080  transcription regulator protein  32.23 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.730873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5630  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 282 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122388  normal  0.561699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3698  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 282 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4881  transcriptional regulator, MerR family  35.32 
 
 		 288 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458694  normal  0.771198 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4670  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 282 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3330  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 272 aa  105  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0993383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1157  transcriptional regulator, MerR family  32.2 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1302  MerR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 268 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2529  MerR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 285 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1468  MerR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 285 aa  96.3  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4060  MerR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 282 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00710658  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0285  MerR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 285 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.184763  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0555  MerR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 285 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1351  MerR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 285 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0327248  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1273  MerR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 285 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1013  MerR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 285 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106241  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4518  MerR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 282 aa  95.1  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584937  normal  0.575813 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0776  regulatory protein MerR  32.26 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1798  hypothetical protein  32.66 
 
 		 269 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5802  transcriptional regulator, MerR family  33.64 
 
 		 284 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0231  transcriptional regulator, MerR family  30.14 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4344  regulatory protein MerR  36.3 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3512  transcriptional regulator, MerR family  56.72 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3819  regulatory protein MerR  38.17 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.977775  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21070  MerR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.471821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1518  MerR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3650  MerR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 259 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0795396  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3723  MerR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 259 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3663  MerR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.532115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4902  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337456  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2531  MerR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 246 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.410302  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 138 aa  57.4  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4126  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1805  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 150 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.589257  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4214  putative transcriptional regulator, MerR family  42.25 
 
 		 319 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  hitchhiker  0.000447036 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 144 aa  52.8  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 137 aa  52.4  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4378  transcriptional regulator, MerR family  47.69 
 
 		 242 aa  52  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  46.27 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 137 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4461  putative transcriptional regulator, MerR family  49.18 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  39.53 
 
 		 129 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1614  transcriptional regulator, MerR family  33.67 
 
 		 295 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.256957  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 152 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  39.02 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 172 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 133 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4066  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 152 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 152 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 136 aa  51.2  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3455  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 152 aa  50.4  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.340256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  39.19 
 
 		 148 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 150 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  39.19 
 
 		 148 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2322  MerR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 139 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2071  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 177 aa  49.3  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.776641  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  40.58 
 
 		 146 aa  49.3  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 146 aa  49.3  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 137 aa  49.3  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 145 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2699  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 171 aa  48.9  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  41.33 
 
 		 129 aa  48.9  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 272 aa  48.5  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  41.79 
 
 		 129 aa  48.5  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  43.28 
 
 		 152 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2122  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 131 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392854  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 129 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1354  transcriptional regulator, MerR family  41.46 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  29 
 
 		 133 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 139 aa  47.4  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0486  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 135 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2382  putative transcriptional regulator, MerR family  40.24 
 
 		 213 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123415  hitchhiker  0.000694345 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 304 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2435  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 135 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2733  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 135 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  41.54 
 
 		 133 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2189  transcriptional regulator, MerR family  34.13 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  32.17 
 
 		 135 aa  47  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7478  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 149 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  30.17 
 
 		 139 aa  46.6  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  30.05 
 
 		 252 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1265  transcriptional regulator, MerR family  45.16 
 
 		 252 aa  46.2  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6980  transcriptional regulator, MerR family  35.11 
 
 		 299 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1157  putative transcriptional regulator, MerR family  31.75 
 
 		 227 aa  46.6  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000331391  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  40.91 
 
 		 162 aa  46.6  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  40.58 
 
 		 142 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3404  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 155 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>