47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4461 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4461  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 258 aa  491  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1319  MerR family transcriptional regulator  45.23 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.228927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2743  putative transcriptional regulator, MerR family  57 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0678087  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4514  putative transcriptional regulator, MerR family  45.95 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.267969  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2382  putative transcriptional regulator, MerR family  35.54 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123415  hitchhiker  0.000694345 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0167  putative transcriptional regulator, MerR family  33.68 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.200853 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1157  transcriptional regulator, MerR family  47.06 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5121  transcriptional regulator, MerR family  49.18 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4750  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  44.07 
 
 		 133 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1709  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 159 aa  48.1  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  44.07 
 
 		 133 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1805  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 150 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.589257  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2128  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 159 aa  47.4  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3990  transcriptional regulator, MerR family  32.43 
 
 		 248 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340501  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1788  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 297 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131469 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1468  MerR family transcriptional regulator  29 
 
 		 285 aa  44.7  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3080  transcription regulator protein  36.47 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.730873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4518  MerR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 282 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584937  normal  0.575813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3602  MerR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1153  MerR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 279 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0304735  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0149  transcriptional regulator, MerR family  47.27 
 
 		 248 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 151 aa  43.5  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4881  transcriptional regulator, MerR family  29.91 
 
 		 288 aa  43.9  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458694  normal  0.771198 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21300  putative transcriptional regulator, MerR family  37.74 
 
 		 126 aa  43.5  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.282314  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4670  MerR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 132 aa  43.5  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3698  MerR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 132 aa  43.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4060  MerR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 282 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00710658  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5630  MerR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 282 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122388  normal  0.561699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 132 aa  43.5  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0285  MerR family transcriptional regulator  29 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.184763  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0555  MerR family transcriptional regulator  29 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1351  MerR family transcriptional regulator  29 
 
 		 285 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0327248  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1273  MerR family transcriptional regulator  29 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2529  MerR family transcriptional regulator  29 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4022  MerR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 279 aa  43.1  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28056  normal  0.857059 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1013  MerR family transcriptional regulator  29 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106241  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 132 aa  42.7  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0776  regulatory protein MerR  42.03 
 
 		 272 aa  42.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1345  transcriptional regulator, MerR family  34.18 
 
 		 246 aa  42  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1302  MerR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 268 aa  42  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4271  transcriptional regulator, MerR family  42.59 
 
 		 262 aa  42  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194258  normal  0.647019 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3819  regulatory protein MerR  34.51 
 
 		 297 aa  42  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.977775  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 146 aa  42  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  31.76 
 
 		 146 aa  42  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>