80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4126 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4126  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 261 aa  527  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2531  MerR family transcriptional regulator  72.76 
 
 		 246 aa  358  4e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.410302  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3663  MerR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.532115 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3723  MerR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 259 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3650  MerR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 259 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0795396  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1518  MerR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 288 aa  108  6e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545801 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4902  MerR family transcriptional regulator  53.41 
 
 		 287 aa  106  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337456  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3819  regulatory protein MerR  42.22 
 
 		 297 aa  99  7e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.977775  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4344  regulatory protein MerR  45.28 
 
 		 264 aa  98.6  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0149  transcriptional regulator, MerR family  32.8 
 
 		 248 aa  95.9  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0462  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 264 aa  95.9  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1798  hypothetical protein  35.45 
 
 		 269 aa  95.5  8e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2333  MerR family transcriptional regulator  46.59 
 
 		 253 aa  92  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3330  MerR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 272 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0993383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1013  MerR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106241  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1302  MerR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 268 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0285  MerR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.184763  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0555  MerR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119185  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2529  MerR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1351  MerR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0327248  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1273  MerR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3602  MerR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 293 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1468  MerR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1153  MerR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 279 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0304735  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4518  MerR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 282 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584937  normal  0.575813 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4060  MerR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 282 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00710658  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4670  MerR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4022  MerR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 279 aa  86.7  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28056  normal  0.857059 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3698  MerR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5630  MerR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122388  normal  0.561699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4881  transcriptional regulator, MerR family  44.94 
 
 		 288 aa  85.9  6e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458694  normal  0.771198 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1788  MerR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 297 aa  85.1  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131469 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3080  transcription regulator protein  42.05 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.730873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0231  transcriptional regulator, MerR family  48.24 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21070  MerR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 232 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.471821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3363  transcriptional regulator, MerR family  41.11 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.65953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3016  transcriptional regulator, MerR family  41.11 
 
 		 272 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3512  transcriptional regulator, MerR family  31.66 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0776  regulatory protein MerR  29.96 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5802  transcriptional regulator, MerR family  37.97 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1157  transcriptional regulator, MerR family  27.95 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4750  transcriptional regulator, MerR family  36.62 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5121  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4271  transcriptional regulator, MerR family  25.43 
 
 		 262 aa  52.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194258  normal  0.647019 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 288 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2029  transcriptional regulator, MerR family  25.25 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1868  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0770  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 151 aa  46.2  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.744449  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0820  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 131 aa  46.2  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.575513  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  34.67 
 
 		 92 aa  45.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 297 aa  45.4  0.0009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3791  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 149 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 147 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 		 123 aa  44.3  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1138  putative transcriptional regulator  39.73 
 
 		 128 aa  43.5  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0775517  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1179  transcriptional regulator, putative  39.73 
 
 		 128 aa  43.5  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0654796  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2071  MerR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 177 aa  43.9  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.776641  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001544  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  31.96 
 
 		 124 aa  43.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1538  MerR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 153 aa  43.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  30.77 
 
 		 138 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 342 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 342 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1898  transcriptional regulator, putative  31.73 
 
 		 134 aa  42.7  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3063  MerR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 142 aa  42.7  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.858131  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2012  MerR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 129 aa  42.7  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.474573  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2321  MerR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 134 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2393  MerR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 134 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 342 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 98 aa  42.7  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2617  transcriptional regulator MerR family  36.99 
 
 		 130 aa  42.7  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874214  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1673  MerR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 134 aa  42.7  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1531  transcriptional regulator, MerR family  32.94 
 
 		 135 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000328  HTH-type transcriptional regulator CueR  31.15 
 
 		 128 aa  42.4  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000737909  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2827  MerR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 135 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2845  MerR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 135 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1098  transcriptional regulator, MerR family  37.29 
 
 		 134 aa  42.7  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2972  MerR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 135 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.54764  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1805  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 150 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.589257  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  40 
 
 		 96 aa  42.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21300  putative transcriptional regulator, MerR family  38.18 
 
 		 126 aa  42.4  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.282314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>