74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3650 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_3723  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3650  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0795396  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3663  MerR family transcriptional regulator  98.07 
 
 		 259 aa  507  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.532115 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2531  MerR family transcriptional regulator  50.61 
 
 		 246 aa  221  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.410302  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4126  MerR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 261 aa  218  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4344  regulatory protein MerR  44 
 
 		 264 aa  102  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4902  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 287 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337456  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1518  MerR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 288 aa  99.4  5e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3819  regulatory protein MerR  42.34 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.977775  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0149  transcriptional regulator, MerR family  31.38 
 
 		 248 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0462  transcriptional regulator, MerR family  48.86 
 
 		 264 aa  95.9  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1351  MerR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0327248  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1273  MerR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1013  MerR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106241  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0555  MerR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119185  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0285  MerR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.184763  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1468  MerR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2529  MerR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1302  MerR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 268 aa  94.4  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1798  hypothetical protein  50 
 
 		 269 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2333  MerR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 253 aa  92.4  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4022  MerR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 279 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28056  normal  0.857059 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1153  MerR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 279 aa  89.4  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0304735  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3602  MerR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 293 aa  87.8  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4518  MerR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584937  normal  0.575813 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5630  MerR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 282 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122388  normal  0.561699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4670  MerR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 282 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3698  MerR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 282 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4060  MerR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00710658  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1788  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 297 aa  85.5  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131469 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3330  MerR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 272 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0993383  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3512  transcriptional regulator, MerR family  48.86 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4881  transcriptional regulator, MerR family  43.02 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458694  normal  0.771198 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3080  transcription regulator protein  43.02 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.730873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3363  transcriptional regulator, MerR family  41.86 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.65953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3016  transcriptional regulator, MerR family  41.86 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0776  regulatory protein MerR  46.34 
 
 		 272 aa  80.1  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0231  transcriptional regulator, MerR family  45.78 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21070  MerR family transcriptional regulator  50.68 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.471821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1157  transcriptional regulator, MerR family  30.41 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5802  transcriptional regulator, MerR family  40.24 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5121  transcriptional regulator, MerR family  47.46 
 
 		 242 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4750  transcriptional regulator, MerR family  39.13 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4271  transcriptional regulator, MerR family  27.18 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194258  normal  0.647019 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 297 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2029  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2071  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 177 aa  46.6  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.776641  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 98 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  37.93 
 
 		 249 aa  45.8  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000328  HTH-type transcriptional regulator CueR  32.26 
 
 		 128 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000737909  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1430  transcriptional regulator, MerR family  41.46 
 
 		 210 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130007  normal  0.485128 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 147 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  36.62 
 
 		 124 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2182  transcriptional regulator, MerR family  36.62 
 
 		 123 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.0034846  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 92 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1808  transcriptional regulator, MerR family  32.06 
 
 		 131 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306071  normal  0.126025 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 125 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1060  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 300 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_004310  BR1179  transcriptional regulator, putative  41.67 
 
 		 128 aa  43.5  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0654796  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  28.08 
 
 		 241 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 136 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1138  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 		 128 aa  43.5  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0775517  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2617  transcriptional regulator MerR family  33.33 
 
 		 130 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874214  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4290  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 130 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.66586 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1773  transcriptional regulator, MerR family  29.87 
 
 		 142 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  31.73 
 
 		 253 aa  42.7  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 149 aa  43.1  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 253 aa  42.7  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2120  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 147 aa  42.7  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00663209  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2012  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 129 aa  42.4  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.474573  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1805  MerR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 150 aa  42  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.589257  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  35.14 
 
 		 122 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1868  transcriptional regulator, MerR family  32.05 
 
 		 247 aa  42  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>