41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1479 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1479  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  475  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342575  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1547  MerR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 242 aa  89  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  30.29 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0186  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0070729  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 288 aa  62.8  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 122 aa  52.8  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2692  regulatory protein, MerR  38.24 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0457116  normal  0.169515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1430  transcriptional regulator, MerR family  38.96 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130007  normal  0.485128 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0210  putative transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024863  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1596  transcriptional regulator, MerR family  24.68 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0557  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1547  transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 239 aa  48.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3156  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 146 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.215145  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2904  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1388  transcriptional regulator, MerR family  32.46 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3466  transcriptional regulator, MerR family  31.43 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0193337  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  37.97 
 
 		 132 aa  46.6  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1444  transcriptional regulator, MerR family  23.73 
 
 		 243 aa  45.8  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0102884  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 137 aa  45.4  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0478  regulatory protein MerR  37.84 
 
 		 205 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0889  transcriptional regulator, MerR family protein  26.85 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000305088  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 137 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 142 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 140 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  41.18 
 
 		 162 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2613  transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726257 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4954  regulatory protein, MerR  25.9 
 
 		 143 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  36.76 
 
 		 156 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  31.37 
 
 		 302 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1748  transcriptional regulator, MerR family  41.51 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  36.76 
 
 		 156 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  40.85 
 
 		 151 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 132 aa  42.7  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 132 aa  42.7  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0962  regulatory protein, MerR  30.39 
 
 		 300 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  40.26 
 
 		 144 aa  42.4  0.007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05650  predicted transcriptional regulator  37.88 
 
 		 217 aa  42.4  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2399  transcriptional regulator, MerR family  32.86 
 
 		 209 aa  42.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562399  decreased coverage  0.00011903 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  40.26 
 
 		 144 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 175 aa  42.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 135 aa  41.6  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>