171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2904 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2904  transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  408  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2613  transcriptional regulator, MerR family  66.01 
 
 		 207 aa  257  8e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726257 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1388  transcriptional regulator, MerR family  31.4 
 
 		 221 aa  81.3  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2399  transcriptional regulator, MerR family  31.22 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562399  decreased coverage  0.00011903 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3466  transcriptional regulator, MerR family  31.43 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0193337  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1131  transcriptional regulator, MerR family  35.1 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1430  transcriptional regulator, MerR family  31.94 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130007  normal  0.485128 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1748  transcriptional regulator, MerR family  28.5 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05650  predicted transcriptional regulator  29.33 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0557  MerR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1547  transcriptional regulator, MerR family  49.18 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2692  regulatory protein, MerR  30.41 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0457116  normal  0.169515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0210  putative transcriptional regulator, MerR family  45.9 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024863  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3179  MerR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.531372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0102  transcriptional regulator  29.67 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.246242  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  34.52 
 
 		 143 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  43.06 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2041  putative transcriptional regulator, MerR family  50.68 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  42.5 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  34.52 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  34.52 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  34.52 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0186  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0070729  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3507  transcriptional regulator, MerR family  43.21 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 146 aa  54.3  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 		 143 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 137 aa  53.5  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 147 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4438  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 143 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  38.89 
 
 		 148 aa  52  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 150 aa  52  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 147 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 138 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 147 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0017  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  35.62 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 152 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 147 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0478  regulatory protein MerR  38.16 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2916  MerR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 154 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221684  normal  0.314176 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1639  MerR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 159 aa  49.7  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.270848  normal  0.040207 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 143 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1596  transcriptional regulator, MerR family  38.71 
 
 		 237 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 143 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 144 aa  48.9  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 140 aa  48.9  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0122  MerR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 143 aa  48.5  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  30.88 
 
 		 144 aa  48.9  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  37.5 
 
 		 148 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1547  MerR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 242 aa  48.5  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 129 aa  48.1  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 137 aa  48.5  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 149 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 144 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  36.99 
 
 		 133 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  34.09 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 143 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  34.67 
 
 		 144 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1479  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342575  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 137 aa  46.6  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  36.23 
 
 		 143 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2326  MerR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 150 aa  47  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01184  Transcriptional regulator, MerR family protein  32.91 
 
 		 137 aa  46.2  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3680  transcriptional regulator, MerR family  30.23 
 
 		 133 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.446637  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 143 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 143 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 136 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 288 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 143 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67550  putative transcriptional regulator  39.24 
 
 		 141 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0955895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  34.72 
 
 		 157 aa  45.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  32 
 
 		 129 aa  45.4  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2509  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 151 aa  45.4  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.591979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  35.62 
 
 		 133 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1157  transcriptional regulator, MerR family  38.95 
 
 		 258 aa  45.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2900  MerR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 140 aa  45.4  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2017  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 140 aa  45.1  0.0007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3338  transcriptional regulator, MerR family  32.53 
 
 		 124 aa  45.1  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.770495  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 134 aa  45.1  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  36.11 
 
 		 159 aa  45.1  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1941  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 140 aa  45.1  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5849  putative transcriptional regulator  37.97 
 
 		 141 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00369897  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  37.21 
 
 		 128 aa  45.1  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0889  transcriptional regulator, MerR family protein  30.88 
 
 		 214 aa  45.1  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000305088  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  36.08 
 
 		 146 aa  45.1  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 172 aa  45.1  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0738  MerR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 126 aa  45.1  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0876776  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6119  MerR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 125 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.0458667 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 133 aa  45.1  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1287  MerR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 155 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422706  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>