284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0017 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0017  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 222 aa  440  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05650  predicted transcriptional regulator  42.18 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3466  transcriptional regulator, MerR family  41.96 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0193337  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1547  transcriptional regulator, MerR family  39.81 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2041  putative transcriptional regulator, MerR family  41.15 
 
 		 213 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1430  transcriptional regulator, MerR family  34.06 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130007  normal  0.485128 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0102  transcriptional regulator  37.56 
 
 		 210 aa  108  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.246242  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1131  transcriptional regulator, MerR family  40.18 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349381  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0557  MerR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848982 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3179  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.531372  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1748  transcriptional regulator, MerR family  33.93 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2399  transcriptional regulator, MerR family  35.14 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562399  decreased coverage  0.00011903 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0210  putative transcriptional regulator, MerR family  41.1 
 
 		 215 aa  96.7  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024863  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2692  regulatory protein, MerR  38.27 
 
 		 210 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0457116  normal  0.169515 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1388  transcriptional regulator, MerR family  31.31 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2904  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2613  transcriptional regulator, MerR family  28 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726257 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  40.51 
 
 		 132 aa  62  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3389  MerR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 132 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.462896  normal  0.11439 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2302  MerR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 132 aa  60.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000169784  hitchhiker  0.000117286 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  40.24 
 
 		 156 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  38.75 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  37.84 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  49.02 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 146 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 149 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  37.33 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1504  regulatory protein, MerR  38.64 
 
 		 141 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3209  MerR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 138 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  48 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 136 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0122  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  48 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  49.02 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2024  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2848  MerR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.66 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  37.66 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.66 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4438  MerR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5322  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 320 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  37.66 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  37.84 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  34.62 
 
 		 148 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0593  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 137 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.429444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  48 
 
 		 144 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  36.25 
 
 		 144 aa  54.7  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  47.27 
 
 		 319 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  36.49 
 
 		 148 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 149 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 143 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 143 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 143 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 143 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 143 aa  52.8  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 132 aa  52.8  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4072  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 140 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.44146 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3339  MerR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 157 aa  52.4  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.88053  normal  0.266963 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3207  putative transcriptional regulator, MerR family  41.77 
 
 		 143 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.789074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 140 aa  52.4  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 		 143 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 		 143 aa  52.4  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  40.58 
 
 		 128 aa  52  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1494  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  40.54 
 
 		 165 aa  51.6  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 147 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4070  transcriptional regulator, MerR family  38.16 
 
 		 132 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2841  transcriptional regulator, MerR family  43.86 
 
 		 125 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.429169  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 137 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0824  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 300 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.39583  normal  0.651241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5717  transcriptional regulator, MerR family  38.38 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  35.9 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  35.9 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 140 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3453  MerR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0445527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 303 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 141 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 147 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  42 
 
 		 136 aa  49.7  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2443  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 140 aa  50.1  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  40.79 
 
 		 152 aa  49.7  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0831  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 145 aa  49.7  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 		 132 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 175 aa  49.7  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 134 aa  49.7  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3979  MerR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 174 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00581953  normal  0.426596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>