172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1547 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1547  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  485  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  31.65 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0186  MerR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 250 aa  90.1  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0070729  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1479  MerR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342575  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1596  transcriptional regulator, MerR family  30.36 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1444  transcriptional regulator, MerR family  29.83 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0102884  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1311  MerR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 243 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1566  MerR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000201032  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0889  transcriptional regulator, MerR family protein  32.59 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000305088  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2692  regulatory protein, MerR  33 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0457116  normal  0.169515 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1851  MerR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 162 aa  57  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.138506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2613  transcriptional regulator, MerR family  46.48 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3466  transcriptional regulator, MerR family  34.04 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0193337  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  51.85 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 132 aa  54.7  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  51.85 
 
 		 156 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 147 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2868  MerR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 129 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000311414  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0210  putative transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024863  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1388  transcriptional regulator, MerR family  33.66 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 162 aa  53.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1748  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1430  transcriptional regulator, MerR family  37.8 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130007  normal  0.485128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 146 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 150 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 144 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1547  transcriptional regulator, MerR family  49.06 
 
 		 239 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3237  MerR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 137 aa  53.1  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  37.74 
 
 		 186 aa  52.4  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 149 aa  52  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 137 aa  51.6  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  32.28 
 
 		 159 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 136 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0189  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528069  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  46.3 
 
 		 148 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  46.3 
 
 		 148 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 137 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2170  transcriptional regulator, MerR family  27.94 
 
 		 133 aa  50.1  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000807108 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  50 
 
 		 152 aa  50.1  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1346  MerR family transcriptional regulator  48 
 
 		 136 aa  49.7  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.24451 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  37.68 
 
 		 145 aa  49.7  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  46.3 
 
 		 157 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 143 aa  48.9  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 144 aa  49.3  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1407  MerR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 134 aa  48.5  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1402  MerR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 133 aa  48.5  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 175 aa  48.5  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 144 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  49.02 
 
 		 128 aa  48.5  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3726  MerR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 140 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1097  transcriptional regulator, MerR family  44.23 
 
 		 133 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 138 aa  48.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2904  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 207 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2051  transcriptional regulator, MerR family  45.28 
 
 		 158 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 144 aa  48.5  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 146 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2399  transcriptional regulator, MerR family  47.17 
 
 		 209 aa  48.5  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562399  decreased coverage  0.00011903 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2421  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  45.28 
 
 		 158 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.732276  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  38.89 
 
 		 130 aa  47.8  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  38.89 
 
 		 130 aa  47.4  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4116  transcriptional regulator, MerR family  44.23 
 
 		 133 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 135 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0557  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848982 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2232  putative transcriptional regulator MerR  35.35 
 
 		 144 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.620327  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 151 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  45.45 
 
 		 151 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  31.03 
 
 		 144 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  42.59 
 
 		 143 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  42.59 
 
 		 160 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4341  putative transcriptional regulator MerR  42.55 
 
 		 151 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1213  transcriptional regulator, MerR family  42.55 
 
 		 144 aa  47.4  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.276419  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0168  putative transcriptional regulator MerR  42.55 
 
 		 144 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0094  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  34.34 
 
 		 136 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  42.59 
 
 		 160 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1217  putative transcriptional regulator MerR  42.55 
 
 		 144 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2129  putative transcriptional regulator MerR  42.55 
 
 		 144 aa  47  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  35.29 
 
 		 146 aa  47  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 146 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3133  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 139 aa  46.6  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.845727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  43.4 
 
 		 144 aa  46.6  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1858  MerR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.14067  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  42.55 
 
 		 144 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  43.4 
 
 		 142 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 149 aa  46.2  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2041  putative transcriptional regulator, MerR family  41.43 
 
 		 213 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4798  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 136 aa  45.8  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 133 aa  45.8  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  39.22 
 
 		 132 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3456  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 149 aa  45.8  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1661  MerR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 137 aa  45.4  0.0007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.282422  normal  0.34807 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 122 aa  45.4  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  29.37 
 
 		 271 aa  45.4  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1338  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 135 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.683374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0853  MerR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 146 aa  44.7  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 143 aa  45.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4014  MerR family transcriptional regulator  42 
 
 		 144 aa  45.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>