71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1858 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1858  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  460  1e-129  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.14067  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0889  transcriptional regulator, MerR family protein  29.77 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000305088  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0123  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.329923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  38.03 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  38.03 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0113  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2613  transcriptional regulator, MerR family  32.43 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726257 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0137  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 143 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3303  MerR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 143 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2932  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 143 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327003  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0123  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 143 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.169164  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  34.72 
 
 		 151 aa  52.4  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 144 aa  52.4  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  34.72 
 
 		 151 aa  52.4  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  29.27 
 
 		 143 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 143 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0122  MerR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 143 aa  52  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  29.27 
 
 		 143 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 143 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 143 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  29.27 
 
 		 143 aa  52  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 143 aa  52  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  36.62 
 
 		 152 aa  51.6  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 138 aa  50.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 147 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3291  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  32.35 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  32.29 
 
 		 148 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  36 
 
 		 186 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 147 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  28.05 
 
 		 143 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1547  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1430  transcriptional regulator, MerR family  28.89 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130007  normal  0.485128 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 147 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 147 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1657  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  47.8  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00996367  normal  0.370586 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  35.71 
 
 		 145 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5283  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 143 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1642  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 143 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  19.62 
 
 		 249 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1336  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 146 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.200551  normal  0.195494 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5351  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 144 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0379309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1155  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 128 aa  46.6  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0258201  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4838  regulatory protein, MerR  34.72 
 
 		 148 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2256  MerR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 144 aa  47  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 144 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0993  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 137 aa  47  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.335093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1547  MerR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 242 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4438  MerR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 143 aa  46.2  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2152  MerR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 137 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.845816  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 152 aa  44.7  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2904  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3563  transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1748  transcriptional regulator, MerR family  29.07 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4323  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 146 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  35.85 
 
 		 143 aa  43.9  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3461  transcriptional regulator, MerR family protein  32.14 
 
 		 146 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5372  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 149 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0210  putative transcriptional regulator, MerR family  35.59 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024863  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1131  transcriptional regulator, MerR family  23.08 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0349381  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  32 
 
 		 252 aa  42.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1816  MerR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 154 aa  43.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0245036  normal  0.855302 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 252 aa  42.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2633  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  27.36 
 
 		 162 aa  42.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.673518 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0478  regulatory protein MerR  43.59 
 
 		 205 aa  42.4  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  28.36 
 
 		 144 aa  42  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05650  predicted transcriptional regulator  33.85 
 
 		 217 aa  42  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  28.12 
 
 		 132 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3373  MerR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 136 aa  41.6  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0297855  normal  0.469131 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3923  transcriptional regulator, MerR family  30.38 
 
 		 156 aa  41.6  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2028  transcriptional regulator, MerR family  31.51 
 
 		 283 aa  41.6  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000014266  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3466  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0193337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>