81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3134 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 244 aa  485  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  82.33 
 
 		 247 aa  397  9.999999999999999e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  83.87 
 
 		 248 aa  394  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  80.56 
 
 		 252 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  80.56 
 
 		 252 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  80.56 
 
 		 252 aa  376  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2338  transcriptional regulator, MerR family  56.33 
 
 		 244 aa  261  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  56.73 
 
 		 240 aa  256  2e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  45.82 
 
 		 252 aa  210  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 245 aa  202  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 249 aa  186  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  48.07 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  48.96 
 
 		 249 aa  185  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  44.67 
 
 		 246 aa  179  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  46.35 
 
 		 225 aa  174  9e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  44.64 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  42.92 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2725  transcriptional regulator, MerR family  42.5 
 
 		 238 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 258 aa  162  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2433  transcriptional regulator, MerR family  45.42 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000601373  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  38.63 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  42.24 
 
 		 258 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  40.97 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  39.92 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  38.96 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13840  predicted transcriptional regulator  40.17 
 
 		 247 aa  145  6e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2101  transcriptional regulator, MerR family  40.26 
 
 		 260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.878958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 271 aa  128  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1126  transcriptional regulator, MerR family  38.66 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5355  transcriptional regulator, MerR family  68.54 
 
 		 313 aa  123  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1301  transcriptional regulator, MerR family  42.94 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.814813 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  33.88 
 
 		 268 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1433  MerR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0281208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3129  transcriptional regulator, MerR family  52 
 
 		 422 aa  99.4  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  28.88 
 
 		 287 aa  91.7  9e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 151 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1311  MerR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 158 aa  51.2  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 292 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2165  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 156 aa  49.3  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0369388  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  37.65 
 
 		 155 aa  48.9  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 176 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 176 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2129  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 150 aa  47.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.802398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  51.06 
 
 		 171 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 157 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  51.06 
 
 		 171 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 156 aa  47  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2489  putative transcriptional regulator, MerR family  41.54 
 
 		 162 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 157 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  33.05 
 
 		 135 aa  46.6  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1099  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 151 aa  46.6  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 157 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 163 aa  45.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1566  MerR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 229 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000201032  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5717  transcriptional regulator, MerR family  41.54 
 
 		 163 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  37.84 
 
 		 152 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  31.03 
 
 		 269 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 276 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 173 aa  43.1  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  42.5 
 
 		 152 aa  42.7  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0954  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 146 aa  42.4  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0450773  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4363  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 143 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0411786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4656  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 143 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.871775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  47.73 
 
 		 158 aa  42.4  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 273 aa  42.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4277  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 143 aa  42.4  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.637089  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  48.84 
 
 		 152 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5793  MerR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 351 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5067  MerR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 351 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424066  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4386  MerR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 340 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  33.9 
 
 		 269 aa  42  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1444  transcriptional regulator, MerR family  24.85 
 
 		 243 aa  42  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0102884  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5668  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 146 aa  42  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1287  MerR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 155 aa  42  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0478  regulatory protein MerR  48.72 
 
 		 205 aa  42  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  30.63 
 
 		 144 aa  42  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  45.45 
 
 		 159 aa  42  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  48.84 
 
 		 152 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>