68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2101 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2101  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 260 aa  504  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.878958 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  51.02 
 
 		 246 aa  211  9e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  48.09 
 
 		 258 aa  208  8e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  50.41 
 
 		 264 aa  202  5e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  42.8 
 
 		 240 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  44.64 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  42.62 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 245 aa  156  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13840  predicted transcriptional regulator  45.85 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2725  transcriptional regulator, MerR family  41.89 
 
 		 238 aa  151  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  42.06 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  44.4 
 
 		 249 aa  149  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  44.83 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  44.1 
 
 		 237 aa  145  6e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 244 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1301  transcriptional regulator, MerR family  45.6 
 
 		 263 aa  145  9e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.814813 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  40.6 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2338  transcriptional regulator, MerR family  38.17 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 248 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2433  transcriptional regulator, MerR family  44.4 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000601373  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  38.93 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 240 aa  133  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  44.68 
 
 		 225 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  38.18 
 
 		 230 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  40.08 
 
 		 268 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  34.89 
 
 		 236 aa  118  7e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1126  transcriptional regulator, MerR family  34.26 
 
 		 262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1433  MerR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0281208  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5355  transcriptional regulator, MerR family  61.54 
 
 		 313 aa  98.6  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3129  transcriptional regulator, MerR family  56.16 
 
 		 422 aa  92.4  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  27.45 
 
 		 287 aa  84  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 292 aa  52.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  52.63 
 
 		 176 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  52.63 
 
 		 171 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  50.88 
 
 		 173 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  52.63 
 
 		 171 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  52.63 
 
 		 176 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  45.07 
 
 		 234 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  45.16 
 
 		 156 aa  45.4  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  49.12 
 
 		 159 aa  45.4  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  36.84 
 
 		 159 aa  45.8  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  43.28 
 
 		 157 aa  45.4  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  50.94 
 
 		 163 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  52.63 
 
 		 153 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 151 aa  45.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  43.28 
 
 		 157 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 158 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0181  MerR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 144 aa  44.3  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.911706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0024  MerR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  46.27 
 
 		 155 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 128 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  38.16 
 
 		 157 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0133  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 151 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 159 aa  43.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 143 aa  42.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 391 aa  43.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 133 aa  43.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 158 aa  42.7  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  44.44 
 
 		 142 aa  42.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1480  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  42.03 
 
 		 148 aa  42  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00810919  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  42.67 
 
 		 137 aa  42  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  44.83 
 
 		 154 aa  42  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>