More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1258 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1258  beta-lactamase  100 
 
 		 377 aa  708    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.775815  normal  0.0157714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2550  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  40.06 
 
 		 489 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1136  beta-lactamase  42.5 
 
 		 357 aa  159  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.167829  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5304  beta-lactamase  37.2 
 
 		 513 aa  146  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2252  beta-lactamase  36.71 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.119961  normal  0.0203286 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0951  beta-lactamase  38.66 
 
 		 345 aa  106  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0224352  decreased coverage  0.0053447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3476  beta-lactamase  35.59 
 
 		 474 aa  95.9  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2704  beta-lactamase  32.14 
 
 		 371 aa  95.9  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1301  beta-lactamase  39.78 
 
 		 417 aa  90.1  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.207216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5715  beta-lactamase  28.57 
 
 		 437 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1795  beta-lactamase  28.12 
 
 		 494 aa  82.8  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.478102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0417  beta-lactam binding protein AmpH  29.79 
 
 		 385 aa  79.7  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.144637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  27.73 
 
 		 848 aa  79.7  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0844  beta-lactam binding protein AmpH  32.02 
 
 		 388 aa  79.7  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0659143 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0409  beta-lactam binding protein AmpH  29.79 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.225371  hitchhiker  0.000170283 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1818  beta-lactamase  32.8 
 
 		 513 aa  79  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0471  beta-lactam binding protein AmpH  29.79 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598882  normal  0.181498 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0411  beta-lactam binding protein AmpH  29.79 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1876  beta-lactamase  31.27 
 
 		 493 aa  78.2  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0429  beta-lactam binding protein AmpH  29.79 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.524845 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  25.15 
 
 		 487 aa  76.6  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00323  beta-lactamase/D-alanine carboxypeptidase  32.19 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3233  beta-lactamase  32.19 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0439  beta-lactam binding protein AmpH  32.19 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00327  hypothetical protein  32.19 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0404  beta-lactam binding protein AmpH  32.19 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3256  beta-lactam binding protein AmpH  32.19 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.896265  normal  0.574239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6777  beta-lactamase  25 
 
 		 446 aa  76.3  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0448  beta-lactam binding protein AmpH  32.19 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0293  beta-lactam binding protein AmpH  32.19 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0398  beta-lactam binding protein AmpH  32.19 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.447104  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2778  beta-lactamase  31.05 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.701087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2573  beta-lactamase  29.03 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.369136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0439  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26.12 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.919528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  26.76 
 
 		 496 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6008  beta-lactamase  34.88 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4257  beta-lactamase  30.18 
 
 		 464 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.240658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2208  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.42 
 
 		 442 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.474098  normal  0.561482 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8711  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.91 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0541056  normal  0.0995944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3468  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.75 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.560934  normal  0.0158413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  26.37 
 
 		 578 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0971  beta-lactamase  29.69 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.596257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0822  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  26.04 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0097  beta-lactamase  29.57 
 
 		 601 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2650  beta-lactamase  29.73 
 
 		 497 aa  70.1  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0361544  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5713  beta-lactamase  33.96 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6077  beta-lactamase  33.96 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.140978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2207  beta-lactamase  28.67 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.124088  hitchhiker  0.00264676 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6561  beta-lactamase  34.43 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.926404  normal  0.294217 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5864  beta-lactamase  33.96 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6205  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.77 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1507  Beta-lactamase  26.29 
 
 		 595 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1929  beta-lactamase  35.11 
 
 		 407 aa  69.3  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6103  beta-lactamase  33.96 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1832  beta-lactamase  25.99 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.29245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0278  beta-lactamase  31.07 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0601  beta-lactam binding protein AmpH  30 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2991  beta-lactamase  28.14 
 
 		 475 aa  67.4  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2638  beta-lactamase  27.08 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.034507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0863  hypothetical protein  28.49 
 
 		 380 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2143  beta-lactamase  31.47 
 
 		 401 aa  66.6  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.559529  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2336  beta-lactamase  25.71 
 
 		 359 aa  66.6  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  26.18 
 
 		 524 aa  66.6  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4733  beta-lactamase  27.73 
 
 		 403 aa  66.6  0.0000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2481  beta-lactamase  24.5 
 
 		 359 aa  66.2  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2736  beta-lactamase  24.64 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.416885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2315  beta-lactamase  32.34 
 
 		 440 aa  65.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00477679  hitchhiker  0.0000358597 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2813  beta-lactamase  27.87 
 
 		 499 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4058  beta-lactamase  31.51 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00809672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10404  lipoprotein lpqK  29.3 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2758  beta-lactam binding protein AmpH  30.36 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000277431  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7532  beta-lactamase  33.33 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1447  beta-lactam binding protein AmpH  30.36 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000414942  normal  0.794569 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2836  beta-lactam binding protein AmpH  30.36 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1755  beta-lactamase  29.71 
 
 		 450 aa  64.7  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0159  beta-lactamase  22.47 
 
 		 410 aa  64.7  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5173  putative beta lactamase family protein  31.37 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.694377  normal  0.230482 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15810  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  30.54 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.091319  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4688  beta-lactamase  26.28 
 
 		 462 aa  63.9  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.331113  normal  0.125502 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0739  beta-lactamase  29.66 
 
 		 381 aa  64.3  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6206  beta-lactamase  26.09 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.324563 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0502  penicillin-binding protein  22.34 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0473  penicillin-binding protein  22.34 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5150  beta-lactamase  25.39 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.175198  normal  0.654906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  24.01 
 
 		 510 aa  63.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0636  beta-lactam binding protein AmpH  31.43 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.259822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2137  beta-lactamase  30.52 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.113996 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2659  beta-lactamase  27.98 
 
 		 662 aa  63.2  0.000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9203  beta-lactamase  27.64 
 
 		 635 aa  62.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.606578 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0863  beta-lactamase  29.17 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3866  beta-lactamase  24.83 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2556  beta-lactamase  31.37 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.400267 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2538  beta-lactamase  31.15 
 
 		 416 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0483  putative penicillin-binding protein  21.98 
 
 		 412 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01660  beta-lactamase  27.8 
 
 		 447 aa  62  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.142612  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4159  beta-lactamase  22.02 
 
 		 544 aa  62  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0453527  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4308  beta-lactamase  27.36 
 
 		 650 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.805936  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3141  beta-lactamase  33.66 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4519  beta-lactamase  30.54 
 
 		 451 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.302372  normal  0.700128 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12878  beta-lactamase, putative  27.59 
 
 		 504 aa  62  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>