52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0565 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0565  hypothetical protein  100 
 
 		 524 aa  1068    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.333932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3201  hypothetical protein  42.32 
 
 		 289 aa  202  9e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00013826  hitchhiker  0.000976632 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4623  hypothetical protein  36.54 
 
 		 680 aa  189  9e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1778  hypothetical protein  37.81 
 
 		 429 aa  176  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00290923  normal  0.113414 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2777  Kelch repeat-containing protein  44.44 
 
 		 1762 aa  108  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0207  hypothetical protein  28.85 
 
 		 376 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0771524 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5502  hypothetical protein  30.37 
 
 		 496 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0681729  normal  0.325123 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  34.65 
 
 		 2170 aa  94  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3929  hypothetical protein  29.74 
 
 		 580 aa  93.2  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6864  hypothetical protein  28.53 
 
 		 533 aa  93.2  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2792  hypothetical protein  37.8 
 
 		 938 aa  90.9  6e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6518  hypothetical protein  29.41 
 
 		 427 aa  87  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.262454  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0293  hypothetical protein  30.69 
 
 		 443 aa  86.7  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.753993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1060  hypothetical protein  26.12 
 
 		 351 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.177161  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3458  hypothetical protein  25.63 
 
 		 649 aa  86.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0801  hypothetical protein  26.87 
 
 		 901 aa  84.7  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0459133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  34.78 
 
 		 662 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  39.6 
 
 		 3802 aa  79.3  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4124  hypothetical protein  34.08 
 
 		 1853 aa  73.6  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.888798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1061  FHA domain-containing protein  25.54 
 
 		 605 aa  72.8  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00105103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4492  hypothetical protein  34.83 
 
 		 1853 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.664727 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3497  hypothetical protein  32.42 
 
 		 1170 aa  71.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1232  PKD domain-containing protein  33.52 
 
 		 2706 aa  71.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4606  hypothetical protein  32.74 
 
 		 1574 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0182  hypothetical protein  31.03 
 
 		 933 aa  66.6  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0795  hypothetical protein  25.44 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.578649  normal  0.0307748 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  33.09 
 
 		 503 aa  62  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0558  hypothetical protein  28.21 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.161142  normal  0.513418 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4377  glycoside hydrolase family protein  36.28 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  31.69 
 
 		 1667 aa  60.8  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  34.71 
 
 		 503 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3671  hypothetical protein  25.88 
 
 		 613 aa  60.8  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  31.48 
 
 		 970 aa  58.5  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  25.6 
 
 		 862 aa  58.2  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0980  glycoside hydrolase family 26  29.01 
 
 		 409 aa  55.5  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00268802 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2816  Beta-galactosidase  27.11 
 
 		 1171 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1231  NHL repeat-containing protein  31.49 
 
 		 1049 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.001634  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4075  glycoside hydrolase family protein  26.22 
 
 		 1175 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589786  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4471  beta-mannanase-like protein  32.52 
 
 		 407 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0091653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2956  beta-mannanase-like protein  28.96 
 
 		 415 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2229  hypothetical protein  30.58 
 
 		 1018 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.394559  normal  0.0986595 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0871  Beta-mannanase-like protein  27.06 
 
 		 442 aa  51.2  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3259  glycoside hydrolase family protein  31.43 
 
 		 330 aa  50.4  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48253  predicted protein  32.31 
 
 		 1461 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0799297  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0404  endoglucanase family protein  27.48 
 
 		 300 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0413  endoglucanase family protein  27.48 
 
 		 285 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.346608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0392  endoglucanase family protein  27.48 
 
 		 285 aa  47.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.564061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0624  Beta-galactosidase  24.16 
 
 		 894 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0265527  normal  0.150404 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3714  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  30.19 
 
 		 506 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4187  Beta-mannanase-like protein  27.03 
 
 		 334 aa  44.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  26.44 
 
 		 490 aa  44.3  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49706  predicted protein  30.85 
 
 		 1222 aa  43.9  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>