More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0480 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0480  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
395 aa  777    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0375  protein of unknown function DUF214  43.52 
 
 
380 aa  253  5.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.421228  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0816  protein of unknown function DUF214  36.32 
 
 
404 aa  186  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27890  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  31.2 
 
 
495 aa  126  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.140819  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2964  protein of unknown function DUF214  28 
 
 
415 aa  113  7.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036613 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8555  ABC transporter related protein  29.44 
 
 
391 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  24.03 
 
 
397 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4329  protein of unknown function DUF214  35.34 
 
 
407 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  31.35 
 
 
407 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8189  ABC transporter related protein  32.08 
 
 
392 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  31.68 
 
 
398 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  31.56 
 
 
438 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  30.48 
 
 
402 aa  97.8  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2849  hypothetical protein  24.46 
 
 
397 aa  95.5  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4326  ABC transporter related protein  29.67 
 
 
391 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361609  normal  0.622554 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  29.36 
 
 
413 aa  95.5  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  25.7 
 
 
406 aa  94  5e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  28.11 
 
 
655 aa  93.6  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  23.63 
 
 
417 aa  93.6  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  29.93 
 
 
395 aa  93.2  7e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25280  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  30.8 
 
 
397 aa  91.7  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.45906  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1627  hypothetical protein  29.53 
 
 
425 aa  91.7  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4788  protein of unknown function DUF214  27.59 
 
 
408 aa  91.3  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.123096  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  30.43 
 
 
391 aa  91.3  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  25.49 
 
 
406 aa  90.9  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5943  hypothetical protein  26.84 
 
 
425 aa  90.1  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  29.01 
 
 
406 aa  89  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.86 
 
 
437 aa  88.2  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0583  protein of unknown function DUF214  28.7 
 
 
403 aa  87.8  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.95878  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0721  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.08 
 
 
410 aa  87.4  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  37.19 
 
 
397 aa  85.9  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.69 
 
 
411 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  25.94 
 
 
405 aa  85.5  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  26.79 
 
 
410 aa  84.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5199  putative permease of ABC transporter  25.84 
 
 
423 aa  85.1  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520248  normal  0.0790722 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2497  protein of unknown function DUF214  28.75 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60780  ABC transporter permease  26.09 
 
 
397 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  28.24 
 
 
415 aa  85.5  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  29.92 
 
 
386 aa  84  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  26.23 
 
 
411 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  28.11 
 
 
405 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  27.18 
 
 
404 aa  83.2  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  27.82 
 
 
404 aa  82.8  0.000000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  32.26 
 
 
408 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  26.71 
 
 
413 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3156  protein of unknown function DUF214  33.7 
 
 
401 aa  81.3  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4072  protein of unknown function DUF214  26.09 
 
 
424 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000314908  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  27.76 
 
 
405 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  31.65 
 
 
404 aa  82  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2826  cell division protein FtsX  32.34 
 
 
453 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  24.09 
 
 
409 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  27.69 
 
 
386 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  27.67 
 
 
657 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  23.92 
 
 
417 aa  80.9  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  25.75 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1028  protein of unknown function DUF214  30.83 
 
 
413 aa  80.5  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  38.66 
 
 
394 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  25.83 
 
 
423 aa  80.1  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  26.17 
 
 
653 aa  80.1  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4027  protein of unknown function DUF214  25.96 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  36.13 
 
 
443 aa  79.7  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  33.55 
 
 
411 aa  79.7  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  36.13 
 
 
452 aa  79  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0078  hypothetical protein  34.62 
 
 
404 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000923125  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  27.86 
 
 
414 aa  79  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  27.45 
 
 
420 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  34.56 
 
 
404 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5233  ABC transporter permease  37.96 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  26.28 
 
 
656 aa  78.2  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  31.65 
 
 
715 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  25.81 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  24.37 
 
 
420 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  25.93 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  36.3 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  27.04 
 
 
420 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  27.13 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  33.58 
 
 
467 aa  77.4  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5607  protein of unknown function DUF214  26.84 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  37.98 
 
 
413 aa  77  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  31.82 
 
 
457 aa  77  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  27.24 
 
 
397 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  38.89 
 
 
409 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  29.96 
 
 
408 aa  76.3  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  28.47 
 
 
406 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  36.43 
 
 
394 aa  76.3  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  29.7 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  23.84 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  36.31 
 
 
411 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  26.09 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  23.33 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  40.68 
 
 
409 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  25.44 
 
 
412 aa  75.1  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3939  protein of unknown function DUF214  22.82 
 
 
414 aa  75.1  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0308  ABC transporter related protein  26.72 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  23.96 
 
 
403 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  25 
 
 
421 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  26.1 
 
 
405 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  27.3 
 
 
408 aa  75.5  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  35.48 
 
 
394 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0490  protein of unknown function DUF214  31.29 
 
 
443 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>