More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0430 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0430  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 420 aa  783    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.263434  normal  0.358827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1437  amino acid permease-associated region  55.5 
 
 		 427 aa  329  7e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.587247 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12031  integral membrane protein  53.98 
 
 		 440 aa  306  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2292  amino acid permease-associated region  54.26 
 
 		 418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.707357  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1879  amino acid permease-associated region  52.35 
 
 		 421 aa  301  2e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.233491  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0141  amino acid permease-associated region  56.23 
 
 		 418 aa  301  2e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.507743  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1945  amino acid permease-associated region  51.84 
 
 		 423 aa  297  3e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0388376  normal  0.012514 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21630  amino acid transporter  56.1 
 
 		 438 aa  292  9e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0187  amino acid permease-associated region  56.11 
 
 		 408 aa  291  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.201505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0557  amino acid permease-associated region  54.99 
 
 		 415 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0569  amino acid permease-associated region  54.99 
 
 		 415 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26617  hitchhiker  0.00748263 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0547  amino acid permease-associated region  54.99 
 
 		 415 aa  289  6e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0423188  normal  0.83486 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0718  amino acid permease-associated region  55.5 
 
 		 408 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0277  amino acid permease-associated region  54 
 
 		 419 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.253615 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0253  amino acid permease-associated region  55.36 
 
 		 411 aa  256  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.323671 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0237  amino acid permease-associated region  51.88 
 
 		 428 aa  249  9e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4180  amino acid permease-associated region  52.23 
 
 		 459 aa  246  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.875127  normal  0.262975 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12800  amino acid transporter  49.45 
 
 		 430 aa  227  3e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2274  amino acid permease-associated region  47.67 
 
 		 407 aa  219  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14890  amino acid transporter  50.41 
 
 		 443 aa  219  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0520437  normal  0.279975 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1095  amino acid permease  37.44 
 
 		 441 aa  204  2e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0988  amino acid permease family protein  37.44 
 
 		 437 aa  199  9e-50  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0097  amino acid permease-associated region  37.93 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00415721  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0050  hypothetical protein  36.57 
 
 		 431 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0048  hypothetical protein  37.06 
 
 		 431 aa  186  8e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4639  amino acid permease-associated region  48.77 
 
 		 441 aa  175  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1826  amino acid permease-associated region  30.53 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2178  amino acid transporter  27.7 
 
 		 422 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0107099  normal  0.19984 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1416  amino acid permease-associated region  26.68 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1710  amino acid permease-associated region  29.22 
 
 		 418 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000301061  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1769  amino acid permease-associated region  27.78 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2924  amino acid permease-associated region  28.39 
 
 		 473 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.670343  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3353  amino acid permease-associated region  26.03 
 
 		 486 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.262265  normal  0.87626 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2114  amino acid permease-associated region  32.97 
 
 		 485 aa  119  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.590902  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0737  amino acid permease-associated region  29.33 
 
 		 506 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000351708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1932  amino acid permease-associated region  31.59 
 
 		 461 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2687  amino acid permease-associated region  30.18 
 
 		 465 aa  114  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.825447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1779  hypothetical protein  31.38 
 
 		 412 aa  113  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1510  amino acid permease-associated region  27.06 
 
 		 495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4173  amino acid permease-associated region  30.66 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.235964  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0746  amino acid permease-associated region  30.57 
 
 		 716 aa  109  9.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200674  normal  0.311948 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  25.61 
 
 		 463 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0385  amino acid permease-associated region  25.45 
 
 		 453 aa  108  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000859435  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3790  amino acid permease-associated region  27.56 
 
 		 491 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.198748  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0018  amino acid permease-associated region  28.47 
 
 		 510 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.190747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4427  amino acid permease-associated region  30.63 
 
 		 452 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.181856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1162  amino acid permease-associated region  28.22 
 
 		 518 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.352905  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2530  amino acid permease-associated region  24.94 
 
 		 449 aa  107  3e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.480015  normal  0.105308 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0026  hypothetical protein  25.39 
 
 		 463 aa  107  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1681  integral membrane protein  37.27 
 
 		 427 aa  107  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  28.77 
 
 		 495 aa  106  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5364  amino acid permease-associated region  29.76 
 
 		 481 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31800  amino acid transporter  32.43 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1634  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 		 476 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.131349  normal  0.325388 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0566  amino acid permease-associated region  30.96 
 
 		 764 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0651  amino acid permease-associated region  26.49 
 
 		 481 aa  103  7e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1042  amino acid permease-associated region  28.88 
 
 		 773 aa  103  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0263  amino acid permease  25.33 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000358452  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1920  amino acid permease-associated region  25.84 
 
 		 466 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000169214  normal  0.866406 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  26.09 
 
 		 440 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0240  amino acid permease-associated region  30.6 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159585 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0096  amino acid permease-associated region  26.35 
 
 		 466 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2084  amino acid permease-associated region  28.53 
 
 		 770 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0277  amino acid transporter, cationic amino acid transporter (CAT) family  25.33 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000621788  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1513  amino acid permease-associated region  32.01 
 
 		 423 aa  102  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.840788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5067  amino acid permease  25.11 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000115655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0258  amino acid permease  25.11 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000104623  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2693  amino acid permease-associated region  27.11 
 
 		 786 aa  100  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0543  amino acid permease-associated region  25.57 
 
 		 456 aa  101  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00639269  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23590  amino acid transporter  26.77 
 
 		 454 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.160802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  27.88 
 
 		 494 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1820  amino acid transport protein  23.88 
 
 		 542 aa  100  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0544653 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1962  amino acid permease-associated region  27.14 
 
 		 476 aa  100  6e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179903  normal  0.921716 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0728  amino acid permease  25.93 
 
 		 467 aa  99.8  7e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0914  amino acid permease family protein  25.93 
 
 		 467 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.43784e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0779  amino acid permease family protein  26.14 
 
 		 467 aa  99.8  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0818  amino acid permease family protein  26.14 
 
 		 467 aa  99.8  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0983  amino acid permease family protein  25.76 
 
 		 467 aa  99.8  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0714  amino acid permease  25.93 
 
 		 467 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0507  amino acid permease-associated region  26.49 
 
 		 471 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778672  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0195  amino acid permease-associated region  26.86 
 
 		 745 aa  99.4  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4348  basic amino acid transporter  26.48 
 
 		 463 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.190712 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0692  amino acid permease-associated region  27.64 
 
 		 820 aa  99.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.145008  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1588  amino-acid transporter transmembrane protein  28.53 
 
 		 476 aa  98.2  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.440422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1930  amino acid permease-associated region  25.28 
 
 		 463 aa  99  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372004  hitchhiker  0.00366235 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4706  alanine permease  26.33 
 
 		 471 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.34441 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0721  amino acid permease family protein  25.98 
 
 		 471 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2379  amino acid permease-associated region  31.37 
 
 		 437 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0365952 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  23.27 
 
 		 494 aa  98.2  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  25.73 
 
 		 500 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0660  amino acid permease family protein  26.64 
 
 		 471 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0562  amino acid permease family protein  26.64 
 
 		 471 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0504  amino acid permease (amino acid transporter)  26.64 
 
 		 471 aa  97.4  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.140308  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0250  amino acid permease-associated region  28.85 
 
 		 465 aa  97.4  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0593  amino acid permease family protein  26.64 
 
 		 471 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0650  amino acid permease family protein  26.64 
 
 		 471 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000109071 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0506  amino acid permease (amino acid transporter)  26.42 
 
 		 471 aa  97.1  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1057  amino acid permease-associated region  26.83 
 
 		 490 aa  97.1  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.422812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0624  hypothetical protein  30.79 
 
 		 411 aa  97.1  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1609  amino acid permease-associated region  26.43 
 
 		 495 aa  97.1  6e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>