255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4059 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_4059  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 
210 aa  425  1e-118  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3431  regulatory protein SenC  57.69 
 
 
206 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2839  electron transport protein SCO1/SenC  57.97 
 
 
207 aa  243  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.819932 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2780  electron transport protein SCO1/SenC  50.49 
 
 
216 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.668811  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2958  electron transport protein SCO1/SenC  52.17 
 
 
231 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0515097 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1519  PrrC  50.24 
 
 
231 aa  203  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.509925  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0171  electron transport protein SCO1/SenC  50.24 
 
 
231 aa  203  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.474246  normal  0.536403 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0014  Classical-complement-pathway C3/C5 convertase  41.24 
 
 
203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.143116  hitchhiker  0.00194121 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42287  predicted protein  40.74 
 
 
291 aa  134  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  42.04 
 
 
198 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3360  electron transport protein SCO1/SenC  39.88 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  42.77 
 
 
215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  37.82 
 
 
287 aa  124  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  45.65 
 
 
215 aa  123  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2865  electron transport protein SCO1/SenC  39.58 
 
 
210 aa  123  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0925437  normal  0.238689 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2853  electron transport protein SCO1/SenC  38.27 
 
 
204 aa  122  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.500235  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57701  Putative cytochrome C oxidase assembly protein  36.09 
 
 
297 aa  120  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0857845  normal  0.0569846 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02680  h-sco1, putative  39.62 
 
 
286 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.648737  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  40.91 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  41.45 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4652  electron transport protein SCO1/SenC  40.91 
 
 
197 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.753044  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2379  electron transport protein SCO1/SenC  41.94 
 
 
204 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778887  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  40.14 
 
 
197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  42.45 
 
 
206 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3419  electron transport protein SCO1/SenC  40.41 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  38.36 
 
 
199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3662  electron transport protein SCO1/SenC  37.58 
 
 
209 aa  112  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.392982  normal  0.146749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0210  electron transport protein SCO1/SenC  38.96 
 
 
197 aa  111  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3768  electron transport protein SCO1/SenC  40.41 
 
 
197 aa  111  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3224  electron transport protein SCO1/SenC  38.62 
 
 
226 aa  109  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.533734  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0885  electron transport protein SCO1/SenC  37.75 
 
 
199 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  38.93 
 
 
197 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305145 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3548  electron transport protein SCO1/SenC  37.93 
 
 
200 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.230336  normal  0.675478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5169  electron transport protein SCO1/SenC  36.49 
 
 
199 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2400  electron transport protein SCO1/SenC  40.52 
 
 
211 aa  105  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_14770  predicted protein  33.75 
 
 
171 aa  105  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00224901  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7280  Electron transport protein SCO1/SenC  36.65 
 
 
166 aa  105  6e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2862  electron transport protein SCO1/SenC  37.01 
 
 
197 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4631  electron transport protein SCO1/SenC  39.01 
 
 
193 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.154208 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2053  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 
199 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.160668 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1992  electron transport protein SCO1/SenC  37.88 
 
 
220 aa  102  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0721  electron transport protein SCO1/SenC  37.16 
 
 
196 aa  101  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.288054 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0888  electron transport protein SCO1/SenC  35.51 
 
 
210 aa  98.2  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147718  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4131  electron transport protein SCO1/SenC  38.1 
 
 
197 aa  98.2  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229515  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3526  electron transport protein SCO1/SenC  34.03 
 
 
203 aa  97.8  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1389  electron transport protein SCO1/SenC  39.2 
 
 
206 aa  95.1  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.324761  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2849  electron transport protein SCO1/SenC  35.51 
 
 
187 aa  95.5  6e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2574  electron transport protein SCO1/SenC  32.22 
 
 
200 aa  95.1  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125643  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2835  electron transport protein SCO1/SenC  35.61 
 
 
200 aa  94.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.954587  normal  0.0193725 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3205  electron transport protein SCO1/SenC  40.14 
 
 
206 aa  94  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0628  electron transport protein SCO1/SenC  32.48 
 
 
191 aa  93.6  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000013207  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3898  electron transport protein SCO1/SenC  37.5 
 
 
207 aa  93.2  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.88916  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3172  putative lipoprotein  33.53 
 
 
198 aa  93.2  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  0.34002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2426  electron transport protein SCO1/SenC  34.72 
 
 
221 aa  92.4  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0897177  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1255  electron transport protein SCO1/SenC  33.16 
 
 
209 aa  92.4  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1235  hypothetical protein  37.78 
 
 
226 aa  92.4  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.392676  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1815  electron transport protein SCO1/SenC  38.81 
 
 
207 aa  92  5e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196226  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1690  electron transport protein SCO1/SenC  36.23 
 
 
201 aa  92  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.805804  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1577  electron transport protein SCO1/SenC  38.24 
 
 
200 aa  91.7  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0135  electron transport protein SCO1/SenC  30 
 
 
197 aa  91.3  9e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  31.29 
 
 
200 aa  90.9  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1998  electron transport protein SCO1/SenC  35.61 
 
 
221 aa  90.9  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  31.38 
 
 
219 aa  89.4  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  32.69 
 
 
203 aa  89.7  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0192  electron transport protein SCO1/SenC  36.43 
 
 
205 aa  89  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1760  electron transport protein SCO1/SenC  36.15 
 
 
196 aa  89  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  32.05 
 
 
203 aa  88.6  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1683  electron transport protein SCO1/SenC  36.44 
 
 
204 aa  88.2  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2858  cytochrome c oxidase assembly factor transmembrane protein  33.58 
 
 
199 aa  88.2  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0934  SCO1/SenC family protein  31.54 
 
 
192 aa  87.4  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.140398  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1061  electron transport protein SCO1/SenC  37.88 
 
 
201 aa  87.8  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.099105  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1066  electron transport protein SCO1/SenC  28.93 
 
 
224 aa  87.4  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.262024  normal  0.435541 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2753  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
205 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453026  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  34.07 
 
 
200 aa  86.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  34.07 
 
 
200 aa  86.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  36.84 
 
 
213 aa  86.7  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3196  electron transport protein SCO1/SenC  31.9 
 
 
188 aa  86.3  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.219637  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2893  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
205 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.945666  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3829  electron transport protein SCO1/SenC  32.64 
 
 
211 aa  85.1  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.707437 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2475  electron transport protein SCO1/SenC  36.36 
 
 
208 aa  85.1  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1565  electron transport protein SCO1/SenC  28.43 
 
 
208 aa  85.5  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000402596  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0467  electron transport protein SCO1/SenC  35.57 
 
 
205 aa  85.5  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0287  electron transport protein SCO1/SenC  34.9 
 
 
205 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0324  electron transport protein SCO1/SenC  33.76 
 
 
231 aa  84.7  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1844  electron transport protein SCO1/SenC  39.45 
 
 
185 aa  84.7  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000125528  decreased coverage  0.00834843 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2223  electron transport protein SCO1/SenC  32.97 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2836  electron transport protein SCO1/SenC  32.97 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1416  SCO1/SenC family protein  34.85 
 
 
196 aa  84  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1380  electron transport protein SCO1/SenC  33.58 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.019613  hitchhiker  0.0000640851 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2847  electron transport protein SCO1/SenC  33.14 
 
 
191 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1655  electron transport protein SCO1/SenC  33.58 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  0.565146 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1372  SCO1/SenC family protein  34.85 
 
 
196 aa  84  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  35 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
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NC_009379  Pnuc_1930  electron transport protein SCO1/SenC  33.33 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009080  BMA10247_2860  SCO1/SenC family protein  34.29 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0159  SCO1/SenC family protein  34.29 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.477348  n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_0337  putative SCO1/SenC family protein  32.65 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.769347  normal  0.0226866 
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_0518  SCO1/SenC family protein  34.29 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.83409  n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_4381  electron transport protein SCO1/SenC  34.4 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
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NC_010681  Bphyt_0555  electron transport protein SCO1/SenC  34.9 
 
 
205 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0945335  normal  0.591506 
 
 
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