More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4013 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_4013  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 636 aa  1266    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  56.61 
 
 		 634 aa  645    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  58.04 
 
 		 640 aa  646    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2280  PAS sensor hybrid histidine kinase  58.14 
 
 		 640 aa  619  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0955  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  58.14 
 
 		 640 aa  617  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.872977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.39 
 
 		 626 aa  590  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.928233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0225  PAS  32.42 
 
 		 673 aa  298  3e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3375  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 		 714 aa  283  5.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.7 
 
 		 676 aa  269  1e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3281  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.04 
 
 		 680 aa  259  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3589  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.92 
 
 		 652 aa  241  4e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.52 
 
 		 673 aa  148  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.92 
 
 		 660 aa  148  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4260  sensor histidine kinase/response regulator  31.45 
 
 		 669 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.71 
 
 		 1415 aa  144  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  28.84 
 
 		 678 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.86 
 
 		 642 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4031  sensory box histidine kinase/response regulator  30.23 
 
 		 851 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0124  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 		 851 aa  140  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4307  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 		 806 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.767019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4095  sensory box histidine kinase/response regulator  29.94 
 
 		 851 aa  139  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  29.26 
 
 		 646 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  28.19 
 
 		 646 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1830  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 		 1165 aa  138  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.22 
 
 		 632 aa  137  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.8 
 
 		 943 aa  137  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3546  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.15 
 
 		 688 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3860  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.27 
 
 		 520 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27 
 
 		 642 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2228  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 		 688 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.899414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  32.15 
 
 		 1164 aa  134  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488954 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 		 653 aa  134  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 741 aa  134  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.15 
 
 		 1164 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2229  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.94 
 
 		 553 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.638317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  27.74 
 
 		 1427 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3901  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 		 661 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0390399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.12 
 
 		 711 aa  132  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1028  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 		 870 aa  131  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.636365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  31.4 
 
 		 531 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 		 927 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.32 
 
 		 651 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.85 
 
 		 795 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.477207 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1031  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 		 689 aa  131  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3545  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.68 
 
 		 553 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.70141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2189  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 		 628 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0671838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2024  fused PAS sensor histidine kinase protein and response regulator  28.8 
 
 		 1005 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00627468  normal  0.216163 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0578  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.04 
 
 		 632 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177294  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4905  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.27 
 
 		 822 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1490  sensory box histidine kinase/response regulator  26.21 
 
 		 695 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.135352  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.13 
 
 		 1426 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2204  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  30.34 
 
 		 588 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0313534  normal  0.331001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 		 957 aa  128  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.79 
 
 		 740 aa  128  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3591  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 		 650 aa  128  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4874  histidine kinase  31.02 
 
 		 544 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.300744  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1084  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.11 
 
 		 678 aa  127  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.48408  normal  0.101861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.49 
 
 		 1022 aa  127  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.1  normal  0.0660292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0540  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 		 1089 aa  127  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0290  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.33 
 
 		 758 aa  127  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.312795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.5 
 
 		 688 aa  127  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0500187 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2043  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 		 691 aa  127  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.10086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3549  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.23 
 
 		 702 aa  127  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1684  histidine kinase  30.03 
 
 		 701 aa  126  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.11 
 
 		 1428 aa  126  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7140  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 		 642 aa  126  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0063  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.99 
 
 		 837 aa  126  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3081  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.98 
 
 		 638 aa  126  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0200059 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.66 
 
 		 999 aa  125  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.73 
 
 		 703 aa  125  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  30.09 
 
 		 533 aa  124  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2725  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.07 
 
 		 834 aa  124  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0569323  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2172  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 		 658 aa  124  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.48 
 
 		 845 aa  124  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5603  hypothetical protein  30.46 
 
 		 756 aa  124  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2956  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.57 
 
 		 650 aa  124  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 		 766 aa  124  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.23 
 
 		 821 aa  124  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3068  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.87 
 
 		 622 aa  124  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.11 
 
 		 834 aa  124  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2842  PAS sensor protein  28.87 
 
 		 622 aa  124  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.174863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1173  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.62 
 
 		 795 aa  124  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.524225  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4430  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.83 
 
 		 571 aa  124  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  30.66 
 
 		 533 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3039  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.16 
 
 		 1067 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.635771  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2057  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 		 774 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.906607  hitchhiker  0.00133985 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.95 
 
 		 508 aa  123  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4268  histidine kinase  29.46 
 
 		 575 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.396925 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2377  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.57 
 
 		 688 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 		 1013 aa  122  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6183  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.12 
 
 		 916 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.24256 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0764  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.85 
 
 		 568 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  25.84 
 
 		 1328 aa  121  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282055  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  28.64 
 
 		 726 aa  121  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.29 
 
 		 845 aa  121  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48160  putative sensor/response regulator hybrid  30.1 
 
 		 858 aa  121  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00217947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.13 
 
 		 721 aa  122  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115994  normal  0.0775846 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.96 
 
 		 692 aa  122  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.95 
 
 		 662 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2960  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.66 
 
 		 622 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>