More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2280 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2280  PAS sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 640 aa  1251    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  90.47 
 
 		 640 aa  1113    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4013  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  58.14 
 
 		 636 aa  661    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  56.37 
 
 		 634 aa  649    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0047  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  59.43 
 
 		 626 aa  661    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.928233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0955  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  99.22 
 
 		 640 aa  1244    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.872977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0225  PAS  37.95 
 
 		 673 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3281  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 		 680 aa  332  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3375  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 		 714 aa  324  3e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.99 
 
 		 676 aa  320  6e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3589  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.71 
 
 		 652 aa  296  7e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6162  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 		 673 aa  189  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30079  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.59 
 
 		 845 aa  189  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3584  sensory box histidine kinase/response regulator  31.45 
 
 		 646 aa  183  7e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2229  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.89 
 
 		 553 aa  183  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.638317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4031  sensory box histidine kinase/response regulator  31.6 
 
 		 851 aa  182  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.28 
 
 		 766 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0124  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.41 
 
 		 851 aa  181  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3083  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 		 845 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3617  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.91 
 
 		 845 aa  179  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4095  sensory box histidine kinase/response regulator  31.21 
 
 		 851 aa  179  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3545  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 		 553 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.70141  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4260  sensor histidine kinase/response regulator  32.88 
 
 		 669 aa  179  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5603  hypothetical protein  36.22 
 
 		 756 aa  179  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1530  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 		 1164 aa  178  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0290  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.5 
 
 		 758 aa  178  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.312795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1329  PAS sensor protein  34.04 
 
 		 1164 aa  177  4e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.488954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.55 
 
 		 651 aa  177  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3692  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.5 
 
 		 951 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.408416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0096  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.2 
 
 		 741 aa  174  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.770159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3211  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.66 
 
 		 696 aa  174  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.7085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2181  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.2 
 
 		 712 aa  173  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.113069  normal  0.344517 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3355  PAS  31.45 
 
 		 646 aa  173  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.996652  normal  0.102892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2148  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.45 
 
 		 655 aa  173  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.440522  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1028  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 		 870 aa  172  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.636365 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.22 
 
 		 1279 aa  172  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4307  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 		 806 aa  171  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.767019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1283  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.82 
 
 		 1322 aa  171  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000035266 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6354  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 		 699 aa  171  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.09 
 
 		 743 aa  171  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1809  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 		 927 aa  170  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.295908 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 740 aa  169  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3277  ATP-binding region, ATPase-like  35.57 
 
 		 812 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.438196  hitchhiker  0.00707292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0517  histidine kinase  33.75 
 
 		 726 aa  169  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.978002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1031  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.55 
 
 		 689 aa  168  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3795  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.18 
 
 		 807 aa  167  4e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.750808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6265  sensor histidine kinase  35.53 
 
 		 490 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0824359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 		 642 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.48 
 
 		 642 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1681  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 		 926 aa  165  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.270935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2399  histidine kinase  34.92 
 
 		 564 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 630 aa  165  3e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.21488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.85 
 
 		 688 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0500187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3549  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 702 aa  164  5.0000000000000005e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3567  histidine kinase  30.23 
 
 		 539 aa  164  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.464366  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2401  sensory box histidine kinase/response regulator  27.76 
 
 		 1015 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 		 721 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0115994  normal  0.0775846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1939  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.96 
 
 		 691 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0201512 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3015  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 		 762 aa  162  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6615  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 660 aa  162  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0224174  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0545  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 1053 aa  162  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920041 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 		 864 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2956  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 		 650 aa  161  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.753222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0495  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 		 1076 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.359716  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3167  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 		 758 aa  161  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000450225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3362  PAS sensor protein  33.02 
 
 		 678 aa  161  4e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7844  sensor histidine kinase  33.07 
 
 		 529 aa  160  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.651552 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2137  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 		 943 aa  160  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1277  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 		 807 aa  160  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.912371  normal  0.18237 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4134  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.51 
 
 		 711 aa  160  9e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.734876  normal  0.920735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 		 653 aa  159  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0873112  normal  0.0648404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1672  PAS sensor protein  31.25 
 
 		 695 aa  159  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.487392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2665  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.91 
 
 		 637 aa  159  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.266574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5329  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.17 
 
 		 936 aa  160  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180092  normal  0.501472 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5422  histidine kinase  31.17 
 
 		 685 aa  159  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0504919 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 		 508 aa  159  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3336  histidine kinase  32.25 
 
 		 531 aa  159  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3461  histidine kinase  31.95 
 
 		 533 aa  158  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5991  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 642 aa  158  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6741  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 		 728 aa  158  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2780  histidine kinase  34.18 
 
 		 558 aa  158  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0036  histidine kinase  34.21 
 
 		 556 aa  158  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.526737  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.22 
 
 		 853 aa  157  4e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0019  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 		 681 aa  158  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.746553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.66 
 
 		 859 aa  157  4e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0018  ATPase domain-containing protein  34.86 
 
 		 681 aa  157  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.434302  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1296  sensory box histidine kinase/response regulator  30.59 
 
 		 726 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00691779  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0284  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.28 
 
 		 1105 aa  157  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0846765 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3139  histidine kinase  31.95 
 
 		 533 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468681  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2375  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 		 766 aa  157  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.63 
 
 		 943 aa  157  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6442  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 		 688 aa  157  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.381857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.79 
 
 		 1415 aa  157  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1990  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 695 aa  157  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1496  sensor histidine kinase/response regulator  32.88 
 
 		 725 aa  157  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000109142  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3282  sensor histidine kinase/response regulator  32.88 
 
 		 760 aa  157  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0788114  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2109  sensor histidine kinase/response regulator  32.88 
 
 		 767 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00292967  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3169  sensor histidine kinase/response regulator  32.88 
 
 		 760 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2403  sensor histidine kinase/response regulator  32.88 
 
 		 760 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00669702  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1872  sensor histidine kinase  31.64 
 
 		 936 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291512  normal  0.670925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>