More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1168 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1168  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 297 aa  603  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.391598 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1524  LysR family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551916 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2586  carbonate dehydratase  40.82 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2204  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 311 aa  205  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.587301  normal  0.0241601 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3395  transcriptional regulator, LysR family  37.8 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.157275 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0793  LysR family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672309  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6689  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.893822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3490  LysR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0152  transcriptional regulator  35.15 
 
 		 296 aa  199  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0977  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 302 aa  199  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00904  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.39 
 
 		 302 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.715492  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2743  transcriptional regulator, LysR family  36.39 
 
 		 302 aa  199  6e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00911  hypothetical protein  36.39 
 
 		 302 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.675817  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1006  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 302 aa  199  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2696  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 302 aa  199  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.731627 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2205  LysR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 300 aa  199  7e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.316824  normal  0.0546535 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4389  LysR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 314 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4274  transcriptional regulator, LysR family  39.73 
 
 		 297 aa  195  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4575  LysR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 322 aa  195  9e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.80821 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4539  transcriptional regulator, LysR family  39.93 
 
 		 302 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2274  LysR family transcriptional regulator  38.11 
 
 		 309 aa  193  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0887334 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3279  LysR family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215676  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1179  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 303 aa  192  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.706209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4298  transcriptional regulator, LysR family  36.18 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2943  LysR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 297 aa  192  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.703981  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3142  LysR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 308 aa  192  8e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0452  LysR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 304 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0025  transcriptional regulator, LysR family  37.29 
 
 		 295 aa  190  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3219  LysR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 301 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.888048  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2916  transcriptional regulator, LysR family  36.08 
 
 		 297 aa  188  7e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4562  transcriptional regulator, LysR family  35.07 
 
 		 298 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.195043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5891  LysR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0761198  normal  0.505648 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3351  LysR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 303 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3178  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0738  LysR family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 296 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3204  LysR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 297 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1924  transcriptional regulator, LysR family  36.77 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2027  LysR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 296 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.446931  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2811  transcriptional regulator, LysR family  33.91 
 
 		 305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0947284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1360  transcriptional regulator, LysR family  35.4 
 
 		 297 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3302  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 298 aa  182  9.000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.510167  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5844  transcriptional regulator, LysR family  35.64 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10316  normal  0.238321 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0900  LysR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42060  putative transcriptional regulator  36.77 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0403  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13446  normal  0.539127 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2471  transcriptional regulator, LysR family  35.54 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4358  LysR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 324 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47080  putative transcriptional regulator  36.86 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.881505 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3337  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.715101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3994  transcriptional regulator LysR family  38.28 
 
 		 297 aa  179  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49790  transcriptional regulator  35.84 
 
 		 303 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3825  hypothetical protein  37.59 
 
 		 311 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0347  transcriptional regulator, LysR family  35.64 
 
 		 308 aa  179  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.102697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3068  transcriptional regulator  35.74 
 
 		 306 aa  178  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3350  transcriptional regulator, LysR family  33.79 
 
 		 301 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0327  LysR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 308 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107285  normal  0.389567 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0366  LysR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3801  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.33 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000297403 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0623  transcriptional regulator, LysR family  35.05 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0767  transcriptional regulator, LysR family  35.05 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3905  LysR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.443804  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2010  transcriptional regulator, LysR family  35.02 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5477  LysR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 301 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1528  LysR family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 307 aa  176  6e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.442273  normal  0.763545 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1771  LysR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 297 aa  176  6e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5385  LysR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 301 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.253203 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4885  LysR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 301 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1059  transcriptional regulator, LysR family  34.71 
 
 		 324 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4800  LysR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.377445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1212  LysR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0322  transcriptional regulator, LysR family  37.33 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.785134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2350  LysR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3851  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 297 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.777047  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1879  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0326  LysR substrate binding domain protein  34.24 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.457404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4241  transcriptional regulator  35.15 
 
 		 303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0489  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2066  transcriptional regulator, LysR family  32.06 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.116356  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3238  LysR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.722588 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1578  transcriptional regulator, LysR family  32.3 
 
 		 297 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801813  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3237  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 297 aa  172  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0527  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 297 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0443839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1585  LysR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 310 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6246  LysR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 310 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.332518  normal  0.708037 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6722  LysR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 310 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1134  transcriptional regulator, LysR family  34.71 
 
 		 297 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.329644 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3612  transcriptional regulator, LysR family  33.94 
 
 		 296 aa  172  9e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0631  LysR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3090  LysR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03073  transcription regulator protein  33.68 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1142  transcriptional regulator, LysR family  32.85 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.406449 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0775  transcriptional regulator, LysR family  32.88 
 
 		 300 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.867257  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5839  LysR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.482004 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6771  transcriptional regulator, LysR family  36.77 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.793683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0040  transcriptional regulator, LysR family  35.74 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2864  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 304 aa  169  4e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.310483  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35510  Regulatory protein, LysR family  32.36 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32470  Transcriptional regulator LysR family protein  32.65 
 
 		 297 aa  169  4e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0049  LysR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 295 aa  169  4e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2317  transcriptional regulator, LysR family  32.65 
 
 		 298 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216454  normal  0.852232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>