More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1711 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2729  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.85 
 
 
1722 aa  641    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.631527  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1711  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
1764 aa  3642    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3350  hypothetical protein  32.83 
 
 
1838 aa  798    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.168378  normal  0.500488 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7833  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.85 
 
 
1723 aa  594  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2665  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.28 
 
 
1698 aa  595  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3296  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.6 
 
 
1734 aa  582  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4772  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.56 
 
 
1741 aa  580  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.232543 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2672  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.5 
 
 
1770 aa  554  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47983 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.81 
 
 
1743 aa  553  1e-156  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.724661  normal  0.480876 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0223  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.19 
 
 
1711 aa  548  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.229884  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1954  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.7 
 
 
1695 aa  536  1e-150  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2590  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.36 
 
 
1672 aa  515  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000259422 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1527  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.09 
 
 
1725 aa  512  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.46826  normal  0.102614 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.77 
 
 
1723 aa  508  9.999999999999999e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0833  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.7 
 
 
1765 aa  508  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.888983 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1302  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.67 
 
 
1719 aa  504  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0274  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.25 
 
 
1754 aa  480  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0352  DEAD/DEAH box helicase-like  27.41 
 
 
1704 aa  472  1.0000000000000001e-131  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2269  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.07 
 
 
1607 aa  340  9.999999999999999e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2319  DEAD/DEAH box helicase domain protein  25.04 
 
 
1525 aa  330  2.0000000000000001e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102202  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1543  DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.04 
 
 
1711 aa  318  5e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1539  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.88 
 
 
1542 aa  317  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1319  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.43 
 
 
2213 aa  301  8e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1124  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  24.7 
 
 
1561 aa  300  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.416463  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0354  Protein of unknown function DUF1998  25.61 
 
 
2087 aa  292  5.0000000000000004e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0806  DEAD/DEAH box helicase-like protein  25.56 
 
 
1543 aa  264  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0821  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.56 
 
 
1543 aa  264  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.301369 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1353  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  21.94 
 
 
2099 aa  190  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1404  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.28 
 
 
1602 aa  190  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4896  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.02 
 
 
2113 aa  176  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.21 
 
 
2113 aa  173  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4830  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.62 
 
 
2113 aa  173  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3883  helicase superfamily protein  38.62 
 
 
2113 aa  173  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0319703  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1673  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.14 
 
 
1589 aa  169  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0511  helicase  26.09 
 
 
1578 aa  168  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.769472  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3253  DEAD/DEAH box helicase-like  23.03 
 
 
2093 aa  167  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.224571  normal  0.0428877 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35200  helicase family protein with metal-binding cysteine cluster  43.2 
 
 
2082 aa  159  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5422  helicase superfamily protein  32.42 
 
 
2224 aa  159  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.383128 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0742  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.35 
 
 
1861 aa  156  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1418  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.45 
 
 
2136 aa  155  8e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411331  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3741  Protein of unknown function DUF1998  33.8 
 
 
2124 aa  149  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4093  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  25.26 
 
 
685 aa  141  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.317776  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3086  helicase superfamily protein  33.71 
 
 
2125 aa  139  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.652376  hitchhiker  0.00603337 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  22.72 
 
 
1787 aa  138  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1679  helicase superfamily protein  25.39 
 
 
1784 aa  135  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2038  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.67 
 
 
2120 aa  132  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.104871 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.74 
 
 
2104 aa  131  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5807  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.6 
 
 
2104 aa  127  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4827  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.6 
 
 
2104 aa  127  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0631  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.71 
 
 
1740 aa  126  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2842  DEAD/DEAH box helicase-like  35.56 
 
 
321 aa  125  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.567167 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3886  helicase superfamily protein  26.6 
 
 
2104 aa  126  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2494  hypothetical protein  31.1 
 
 
2106 aa  124  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  24.35 
 
 
1759 aa  118  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3298  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.68 
 
 
1741 aa  108  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4091  helicase domain-containing protein  27.38 
 
 
1422 aa  107  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0240  helicase superfamily protein  44.86 
 
 
2097 aa  98.2  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1964  helicase domain protein  24.89 
 
 
1780 aa  90.1  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.285846  normal  0.0141604 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0546  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.48 
 
 
740 aa  89  8e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1002  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.9 
 
 
739 aa  87.8  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2860  helicase domain protein  25.76 
 
 
459 aa  87.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00993541  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0861  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.82 
 
 
744 aa  87.8  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1020  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.22 
 
 
744 aa  87  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  1.28402e-16 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.82 
 
 
803 aa  86.7  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111055  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0076  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.74 
 
 
962 aa  86.3  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1320  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.43 
 
 
815 aa  85.5  0.000000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000000720865 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1953  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.48 
 
 
959 aa  84.3  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.212606  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1686  Protein of unknown function DUF1998  32.63 
 
 
931 aa  84  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0484  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.95 
 
 
941 aa  83.6  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0368983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1910  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.67 
 
 
752 aa  82  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71131  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2198  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.23 
 
 
1198 aa  82  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38435  predicted protein  32.37 
 
 
758 aa  81.6  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2251  Protein of unknown function DUF1998  31.56 
 
 
797 aa  81.3  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.216915 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0302  putative helicase  23.76 
 
 
1878 aa  81.3  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2375  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.49 
 
 
758 aa  80.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2723  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.52 
 
 
1053 aa  80.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215301  normal  0.377392 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  23.36 
 
 
1948 aa  80.9  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160999  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2983  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.87 
 
 
972 aa  79.7  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1438  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.61 
 
 
807 aa  79  0.0000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2843  ATP-dependant helicase  33.33 
 
 
912 aa  78.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00245951  normal  0.0337718 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3603  DEAD/DEAH box helicase-like  29.96 
 
 
986 aa  78.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0836836  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14630  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.02 
 
 
751 aa  78.2  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000706515  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4387  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.85 
 
 
1489 aa  77.4  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.351978  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0816  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.28 
 
 
685 aa  76.3  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.710147  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3683  DEAD/DEAH box helicase-like  29.33 
 
 
905 aa  75.9  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.91 
 
 
973 aa  75.9  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.273362 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0012  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.38 
 
 
762 aa  75.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0793231  hitchhiker  0.00171802 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.36 
 
 
855 aa  74.7  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1523  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.48 
 
 
744 aa  75.1  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.750209  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1457  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.58 
 
 
744 aa  75.1  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.507421  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1707  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.61 
 
 
808 aa  74.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0661739  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0077  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.55 
 
 
1086 aa  74.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2637  helicase-like protein  29.17 
 
 
1528 aa  73.9  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.209062  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1675  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.69 
 
 
790 aa  73.6  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8451  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.22 
 
 
806 aa  73.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113754 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0080  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.35 
 
 
829 aa  72.8  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.412671 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3810  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.11 
 
 
911 aa  72.4  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5321  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.42 
 
 
764 aa  72.4  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0653251  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03333  ATP-dependent RNA helicase  25.59 
 
 
831 aa  72  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10757  DEAD/DEAH box helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10820)  31.1 
 
 
1210 aa  71.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0139643  normal  0.823621 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>