More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0812 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0812  Homoserine dehydrogenase  100 
 
 
319 aa  626  1e-178  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0498  Homoserine dehydrogenase  72.96 
 
 
317 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0818  Homoserine dehydrogenase  73.73 
 
 
315 aa  437  1e-121  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2515  Homoserine dehydrogenase  71.75 
 
 
319 aa  426  1e-118  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.527227  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0155  homoserine dehydrogenase  67.78 
 
 
328 aa  400  9.999999999999999e-111  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1993  homoserine dehydrogenase  45.06 
 
 
328 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.186855 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0971  homoserine dehydrogenase  46.39 
 
 
328 aa  246  3e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0496504  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2292  homoserine dehydrogenase  45 
 
 
330 aa  236  3e-61  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1354  homoserine dehydrogenase  43.3 
 
 
328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0271184  normal  0.0214619 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1087  homoserine dehydrogenase  41.12 
 
 
331 aa  233  3e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0481  homoserine dehydrogenase  44.24 
 
 
328 aa  226  6e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1898  homoserine dehydrogenase  38.01 
 
 
331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.866651  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1209  homoserine dehydrogenase  35.52 
 
 
340 aa  206  4e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1704  homoserine dehydrogenase  37.05 
 
 
337 aa  203  3e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.54708  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0845  homoserine dehydrogenase  39.31 
 
 
335 aa  203  3e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.632619  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0977  homoserine dehydrogenase  37.05 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0969  homoserine dehydrogenase  36.45 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1004  homoserine dehydrogenase  35.24 
 
 
337 aa  189  7e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1922  homoserine dehydrogenase  41.54 
 
 
436 aa  177  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0696  homoserine dehydrogenase  32.54 
 
 
336 aa  171  1e-41  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2086  homoserine dehydrogenase  38.97 
 
 
355 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1274  homoserine dehydrogenase  40.12 
 
 
439 aa  170  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61587  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1917  homoserine dehydrogenase  40.12 
 
 
439 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1237  homoserine dehydrogenase  39.81 
 
 
439 aa  167  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0179197  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1280  homoserine dehydrogenase  32.62 
 
 
428 aa  166  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000268679  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2279  homoserine dehydrogenase  38.94 
 
 
440 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.010802  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1545  homoserine dehydrogenase  38.11 
 
 
441 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.927693  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1453  homoserine dehydrogenase  37.46 
 
 
440 aa  159  7e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0771081  hitchhiker  0.000482851 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3264  homoserine dehydrogenase  40.12 
 
 
440 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1739  homoserine dehydrogenase  37.5 
 
 
441 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.150104 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0498  Homoserine dehydrogenase  33.85 
 
 
441 aa  157  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5063  homoserine dehydrogenase  34.22 
 
 
353 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1073  homoserine dehydrogenase  39.45 
 
 
431 aa  156  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.830496  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2919  homoserine dehydrogenase  39.76 
 
 
438 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.256136  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1833  homoserine dehydrogenase  34.58 
 
 
431 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000106835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5533  homoserine dehydrogenase  35.51 
 
 
431 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000461441  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1629  homoserine dehydrogenase  34.64 
 
 
436 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000170153  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1319  homoserine dehydrogenase  34.36 
 
 
432 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3560  homoserine dehydrogenase  37.8 
 
 
349 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1792  Homoserine dehydrogenase  35.65 
 
 
410 aa  153  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.776868  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5197  homoserine dehydrogenase  34.89 
 
 
431 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000108482  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1231  homoserine dehydrogenase  35.37 
 
 
436 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000207213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5527  homoserine dehydrogenase  35.51 
 
 
431 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000793551  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1294  homoserine dehydrogenase  40.51 
 
 
438 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333989  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2698  homoserine dehydrogenase  40.43 
 
 
440 aa  152  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.491627 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2178  homoserine dehydrogenase  39.84 
 
 
436 aa  152  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000677281  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2233  Homoserine dehydrogenase  34.89 
 
 
429 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5256  homoserine dehydrogenase  35.2 
 
 
417 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5085  homoserine dehydrogenase  35.2 
 
 
431 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.2100400000000005e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5102  homoserine dehydrogenase  35.51 
 
 
431 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000707166  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5654  homoserine dehydrogenase  35.2 
 
 
417 aa  151  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2987  homoserine dehydrogenase  37.46 
 
 
353 aa  152  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2816  homoserine dehydrogenase  36.7 
 
 
440 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0355119  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0217  homoserine dehydrogenase  36.14 
 
 
422 aa  151  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5583  homoserine dehydrogenase  35.2 
 
 
431 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000640216  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5499  homoserine dehydrogenase  35.2 
 
 
431 aa  151  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2946  homoserine dehydrogenase  38.84 
 
 
438 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.470523  hitchhiker  0.00956277 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5424  homoserine dehydrogenase  35.51 
 
 
431 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000131311  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3019  homoserine dehydrogenase  35.37 
 
 
436 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.196677  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1214  homoserine dehydrogenase  41.18 
 
 
439 aa  150  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.610813  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2073  homoserine dehydrogenase  33.44 
 
 
431 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000583886  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1451  homoserine dehydrogenase  39.37 
 
 
436 aa  149  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0294426  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2051  homoserine dehydrogenase  33.75 
 
 
431 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000000682856  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1496  homoserine dehydrogenase  33.54 
 
 
431 aa  149  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000888865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08020  Homoserine dehydrogenase  34.77 
 
 
428 aa  149  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00145956  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1298  homoserine dehydrogenase  38.75 
 
 
429 aa  149  8e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.220896  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1799  homoserine dehydrogenase  33.96 
 
 
431 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000101112  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1782  homoserine dehydrogenase  33.33 
 
 
431 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000962498  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6156  homoserine dehydrogenase  38.39 
 
 
437 aa  148  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2002  homoserine dehydrogenase  33.96 
 
 
431 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.97211e-42 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1120  homoserine dehydrogenase  32.81 
 
 
427 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3357  homoserine dehydrogenase  34.67 
 
 
431 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000776779  hitchhiker  0.0000000000000153731 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0169  Homoserine dehydrogenase  36.88 
 
 
423 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0506  homoserine dehydrogenase  34.47 
 
 
428 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1825  homoserine dehydrogenase  33.96 
 
 
431 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000204455  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1968  homoserine dehydrogenase  33.96 
 
 
431 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000153616  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1387  homoserine dehydrogenase  38.39 
 
 
433 aa  147  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1693  homoserine dehydrogenase  35.6 
 
 
436 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.240016  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0373  aspartate kinase  35.6 
 
 
739 aa  145  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3923  homoserine dehydrogenase  34.58 
 
 
431 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0403  homoserine dehydrogenase  38.89 
 
 
428 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0664  homoserine dehydrogenase  35.01 
 
 
347 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1970  homoserine dehydrogenase  34.06 
 
 
431 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000450684  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2479  homoserine dehydrogenase  32.92 
 
 
431 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000845982  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0506  Homoserine dehydrogenase  32.52 
 
 
336 aa  145  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.614474  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1414  homoserine dehydrogenase  34.16 
 
 
417 aa  145  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2057  homoserine dehydrogenase  38.89 
 
 
428 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2504  homoserine dehydrogenase  39.82 
 
 
437 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.240754 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2896  homoserine dehydrogenase  34.91 
 
 
432 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000776589  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0633  Homoserine dehydrogenase  40.08 
 
 
440 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0473  homoserine dehydrogenase  40.08 
 
 
436 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.243911  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2273  homoserine dehydrogenase  37.27 
 
 
428 aa  142  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1413  Homoserine dehydrogenase  32.81 
 
 
427 aa  142  6e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0390  aspartate kinase  34.46 
 
 
720 aa  142  6e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.150199  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0834  homoserine dehydrogenase  38.58 
 
 
428 aa  142  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.354577  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1153  homoserine dehydrogenase  33.59 
 
 
431 aa  142  8e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29960  homoserine dehydrogenase  37.31 
 
 
435 aa  142  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.316123 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2243  homoserine dehydrogenase  40.62 
 
 
440 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.550813  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2309  homoserine dehydrogenase  37.16 
 
 
440 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1967  homoserine dehydrogenase  40.31 
 
 
440 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.170125  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>