248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4159 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4159  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
133 aa  267  2.9999999999999997e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.588084  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2890  thioesterase superfamily protein  45.6 
 
 
130 aa  86.3  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0402  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.2 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.925599  decreased coverage  0.0065275 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1555  phenylacetic acid degradation-related protein  38.4 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000594632  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1384  thioesterase superfamily protein  38.18 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00487893 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0232  hypothetical protein  39.25 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000358883  normal  0.422713 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1848  phenylacetic acid degradation-related protein  29.66 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.651709 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1169  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0798607  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1324  phenylacetic acid degradation protein PaaD  36.04 
 
 
124 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0859981 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1645  phenylacetic acid degradation protein  34.4 
 
 
136 aa  58.2  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3719  thioesterase superfamily protein  37.3 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.670455 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3080  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.8 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.378312 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1130  uncharacterized aromatic compound catabolism protein  33.33 
 
 
143 aa  57.4  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
149 aa  57  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0256  phenylacetic acid degradation-related protein  31.67 
 
 
127 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0152  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0009  thioesterase superfamily protein  32.11 
 
 
161 aa  56.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.239362  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2334  phenylacetic acid degradation-related protein  38.74 
 
 
148 aa  56.6  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.788653  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68720  hypothetical protein  36.08 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  27.78 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20340  phenylacetic acid degradation protein PaaD  31.67 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5946  hypothetical protein  37.11 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1352  phenylacetic acid degradation-related protein  37.86 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0602688  normal  0.0191166 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0937  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.82 
 
 
149 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0326  hypothetical protein  30 
 
 
127 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1955  hypothetical protein  34.82 
 
 
154 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0258  phenylacetic acid degradation-like protein  35.71 
 
 
127 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4968  thioesterase superfamily protein  33.98 
 
 
127 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0386  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 
130 aa  54.3  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0130  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 
133 aa  54.3  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5269  thioesterase superfamily protein  38.54 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1737  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
131 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000190297  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1701  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 
142 aa  53.9  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000649367  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2725  hypothetical protein  37.37 
 
 
139 aa  53.9  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227309  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2669  phenylacetic acid degradation-related protein  33.04 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747911 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2507  phenylacetic acid degradation-like protein  35.14 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0305334  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2154  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 
147 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.770141  normal  0.098751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1553  thioesterase superfamily protein  34.13 
 
 
146 aa  52.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0269  thioesterase superfamily protein  34 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.357233  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2249  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.33 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0320405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1581  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.33 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0467  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2403  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
139 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2353  phenylacetic acid degradation-like protein  32.43 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.360376 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  45.61 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2259  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.33 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.059519  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.33 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26560  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.48 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3441  thioesterase superfamily protein  32.43 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.592897  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06440  hypothetical protein  30.39 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0244  thioesterase superfamily protein  31.31 
 
 
127 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.270075  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1299  thioesterase superfamily protein  31.73 
 
 
133 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1898  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
136 aa  51.2  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0657  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0259  thioesterase superfamily protein  31.31 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0417861 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04930  hypothetical protein  31.5 
 
 
145 aa  51.2  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0932  hypothetical protein  30.56 
 
 
140 aa  50.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.783241 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1432  hypothetical protein  30.83 
 
 
160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0530833  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2450  thioesterase family protein  30.83 
 
 
160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2288  hypothetical protein  30.83 
 
 
160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0356386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2327  hypothetical protein  30.83 
 
 
160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1196  hypothetical protein  30.83 
 
 
160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1397  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 
172 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
128 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1923  hypothetical protein  30.83 
 
 
160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3381  hypothetical protein  30.83 
 
 
160 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364467  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2937  phenylacetic acid degradation-like protein  33.33 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.332446  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0658  phenylacetic acid degradation protein PaaD  27.42 
 
 
146 aa  50.4  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2871  phenylacetic acid degradation protein  30.7 
 
 
152 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.165217  normal  0.133325 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2147  hypothetical protein  31.71 
 
 
160 aa  50.1  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.505832  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1470  hypothetical protein  28.46 
 
 
133 aa  50.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.966701  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0102  thioesterase superfamily protein  37.27 
 
 
144 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306463  normal  0.0212661 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1143  hypothetical protein  29.7 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00674894  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4483  phenylacetic acid degradation protein PaaD  42.7 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.18352  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0439  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.07 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2608  phenylacetic acid degradation-related protein  35.79 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824711  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6416  hypothetical protein  36 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.586823  normal  0.782807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2638  hypothetical protein  32.8 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3355  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.402541  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2652  hypothetical protein  35.79 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6128  thioesterase superfamily protein  36 
 
 
138 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.892734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5525  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.74 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.717257  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  31.96 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2248  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 
138 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0759  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000728141  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1180  hypothetical protein  30.09 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.433155  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1830  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.82 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.307923  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5294  hypothetical protein  40.35 
 
 
155 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2320  phenylacetic acid degradation protein PaaD  32.23 
 
 
125 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0373  phenylacetic acid degradation-related protein:phenylacetic acid degradation protein PaaD  30.25 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000506078  hitchhiker  0.00000423415 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1795  phenylacetic acid degradation-related protein  28.72 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.560349  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0432  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 
121 aa  47.8  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3635  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.95 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.182413  normal  0.29852 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4800  phenylacetic acid degradation protein PaaD  28.07 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.283675  normal  0.204675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3361  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.754262 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2854  phenylacetic acid degradation protein PaaD  33.33 
 
 
152 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0283833  normal  0.621321 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1689  thioesterase superfamily protein  39.24 
 
 
154 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0067  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 
182 aa  47  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2542  thioesterase superfamily protein  35.42 
 
 
146 aa  47  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3576  phenylacetic acid degradation protein PaaD  35.09 
 
 
158 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>