38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5294 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_5294  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  311  1.9999999999999998e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5195  hypothetical protein  59.03 
 
 
154 aa  165  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0603598  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0523  hypothetical protein  55.1 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680982  hitchhiker  0.005662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0436  hypothetical protein  54.55 
 
 
143 aa  144  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0304  hypothetical protein  50 
 
 
148 aa  144  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0085  hypothetical protein  46.21 
 
 
151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.623619  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3475  hypothetical protein  34.07 
 
 
173 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.21997  normal  0.540181 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4086  hypothetical protein  33.58 
 
 
173 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5763  hypothetical protein  31.39 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66450  hypothetical protein  31.85 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30030  hypothetical protein  36.64 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2571  hypothetical protein  33.58 
 
 
171 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3955  hypothetical protein  31.85 
 
 
170 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0785273  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0622  hypothetical protein  35.25 
 
 
162 aa  61.2  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0555  hypothetical protein  30.08 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129509 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4134  hypothetical protein  31.34 
 
 
166 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.330749  normal  0.0332263 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  29.84 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2032  hypothetical protein  30.22 
 
 
230 aa  48.5  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3065  hypothetical protein  29.41 
 
 
155 aa  47.4  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840147  normal  0.26406 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  33 
 
 
154 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1439  hypothetical protein  32.54 
 
 
184 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1022  thioesterase superfamily protein  32.65 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2882  thioesterase superfamily protein  35.11 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0984  phenylacetic acid degradation-related protein  33.33 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.299901  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0251  hypothetical protein  29.2 
 
 
238 aa  44.3  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.615513 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  25.68 
 
 
149 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0225  hypothetical protein  30.93 
 
 
244 aa  43.9  0.0009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1955  hypothetical protein  32.5 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4670  thioesterase superfamily protein  32.35 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.614434 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3439  hypothetical protein  27.33 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0186  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 
142 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2083  hypothetical protein  37.88 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.760397  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1128  hypothetical protein  38.6 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2152  thioesterase superfamily protein  38.37 
 
 
144 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3460  hypothetical protein  30.77 
 
 
143 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40800  hypothetical protein  30.77 
 
 
145 aa  41.2  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4159  thioesterase superfamily protein  41.86 
 
 
133 aa  40.8  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.588084  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2935  hypothetical protein  30.67 
 
 
180 aa  40.4  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0628257 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>