45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3955 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3955  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  351  2.9999999999999997e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0785273  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3475  hypothetical protein  84.47 
 
 		 173 aa  290  6e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.21997  normal  0.540181 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4086  hypothetical protein  65.62 
 
 		 173 aa  236  2e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0622  hypothetical protein  46.79 
 
 		 162 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2571  hypothetical protein  45 
 
 		 171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30030  hypothetical protein  43.71 
 
 		 184 aa  137  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0225  hypothetical protein  36.88 
 
 		 244 aa  115  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0251  hypothetical protein  36.88 
 
 		 238 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.615513 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2032  hypothetical protein  34.55 
 
 		 230 aa  113  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5195  hypothetical protein  31.91 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0603598  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4134  hypothetical protein  28.89 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.330749  normal  0.0332263 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0304  hypothetical protein  31.16 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5294  hypothetical protein  31.85 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0523  hypothetical protein  33.09 
 
 		 154 aa  60.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680982  hitchhiker  0.005662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0436  hypothetical protein  32.37 
 
 		 143 aa  60.5  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3041  hypothetical protein  28.14 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3065  hypothetical protein  28.89 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840147  normal  0.26406 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3850  hypothetical protein  31.25 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207149  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2841  hypothetical protein  28 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1106  hypothetical protein  26.35 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0959  hypothetical protein  26.54 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2784  hypothetical protein  26.39 
 
 		 158 aa  50.8  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0929  hypothetical protein  26.14 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2797  hypothetical protein  26.54 
 
 		 164 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1205  hypothetical protein  25.9 
 
 		 163 aa  48.9  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1293  hypothetical protein  25 
 
 		 166 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.792696 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2880  hypothetical protein  25.93 
 
 		 164 aa  48.1  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3074  hypothetical protein  25 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3083  hypothetical protein  25 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1037  hypothetical protein  23.03 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0637557  normal  0.475125 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3226  hypothetical protein  25 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40800  hypothetical protein  26.27 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2976  hypothetical protein  25.31 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2528  hypothetical protein  26.37 
 
 		 145 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.320049  normal  0.260243 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00554  Thioesterase (4HBT) superfamily enzyme  26.09 
 
 		 153 aa  44.3  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3460  hypothetical protein  28.12 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5832  hypothetical protein  24.49 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4932  hypothetical protein  25.47 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5763  hypothetical protein  31.11 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0085  hypothetical protein  24.44 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.623619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66450  hypothetical protein  31.11 
 
 		 150 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0555  hypothetical protein  34.78 
 
 		 147 aa  42  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129509 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0892  hypothetical protein  29.41 
 
 		 157 aa  41.6  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44213  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1599  hypothetical protein  25.41 
 
 		 145 aa  40.8  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2935  hypothetical protein  25.17 
 
 		 180 aa  40.8  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0628257 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>