44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00554 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_00554  Thioesterase (4HBT) superfamily enzyme  100 
 
 
153 aa  317  3.9999999999999996e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2841  hypothetical protein  63.76 
 
 
158 aa  206  7e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1106  hypothetical protein  63.27 
 
 
159 aa  200  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3074  hypothetical protein  62.42 
 
 
166 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1205  hypothetical protein  63.09 
 
 
163 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1293  hypothetical protein  61.74 
 
 
166 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.792696 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3226  hypothetical protein  61.74 
 
 
166 aa  197  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3083  hypothetical protein  61.74 
 
 
166 aa  197  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4932  hypothetical protein  63.09 
 
 
156 aa  196  7e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3041  hypothetical protein  63.09 
 
 
158 aa  196  7.999999999999999e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1037  hypothetical protein  61.22 
 
 
158 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0637557  normal  0.475125 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2880  hypothetical protein  61.74 
 
 
164 aa  193  6e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0929  hypothetical protein  61.22 
 
 
166 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2784  hypothetical protein  61.07 
 
 
158 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2797  hypothetical protein  61.07 
 
 
164 aa  192  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0959  hypothetical protein  59.18 
 
 
158 aa  192  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2976  hypothetical protein  61.07 
 
 
164 aa  192  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3850  hypothetical protein  50 
 
 
154 aa  157  5e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207149  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1399  hypothetical protein  64.95 
 
 
109 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04700  hypothetical protein  43.33 
 
 
157 aa  134  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5832  hypothetical protein  39.33 
 
 
160 aa  124  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3065  hypothetical protein  41.61 
 
 
155 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840147  normal  0.26406 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2528  hypothetical protein  47.01 
 
 
145 aa  120  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.320049  normal  0.260243 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3537  phenylacetic acid degradation-like protein  41.55 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3460  hypothetical protein  44.44 
 
 
143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40800  hypothetical protein  44.78 
 
 
145 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0806  hypothetical protein  37.93 
 
 
145 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1177  thioesterase  37.93 
 
 
145 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1101  hypothetical protein  37.93 
 
 
145 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1770  hypothetical protein  37.93 
 
 
145 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0659  hypothetical protein  37.93 
 
 
145 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2388  thioesterase (4HBT) superfamily protein  37.93 
 
 
145 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0892  hypothetical protein  34.42 
 
 
157 aa  108  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44213  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1599  hypothetical protein  37.41 
 
 
145 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3439  hypothetical protein  39.87 
 
 
161 aa  101  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4134  hypothetical protein  29.22 
 
 
166 aa  84.3  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.330749  normal  0.0332263 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2032  hypothetical protein  32.04 
 
 
230 aa  54.7  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0251  hypothetical protein  29.13 
 
 
238 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.615513 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0225  hypothetical protein  30.77 
 
 
244 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0622  hypothetical protein  29.79 
 
 
162 aa  47.8  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2571  hypothetical protein  25 
 
 
171 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3955  hypothetical protein  26.09 
 
 
170 aa  44.3  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0785273  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30030  hypothetical protein  25.58 
 
 
184 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4086  hypothetical protein  26.87 
 
 
173 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>