46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2528 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2528  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  298  1e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.320049  normal  0.260243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3460  hypothetical protein  80.14 
 
 		 143 aa  239  9e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40800  hypothetical protein  82.09 
 
 		 145 aa  230  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0659  hypothetical protein  60.84 
 
 		 145 aa  176  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2388  thioesterase (4HBT) superfamily protein  60.84 
 
 		 145 aa  176  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1770  hypothetical protein  60.84 
 
 		 145 aa  176  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1101  hypothetical protein  60.84 
 
 		 145 aa  176  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1177  thioesterase  60.84 
 
 		 145 aa  176  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0806  hypothetical protein  60.84 
 
 		 145 aa  176  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1599  hypothetical protein  59.72 
 
 		 145 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3537  phenylacetic acid degradation-like protein  60.14 
 
 		 146 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2784  hypothetical protein  43.92 
 
 		 158 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4932  hypothetical protein  45.52 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1106  hypothetical protein  47.76 
 
 		 159 aa  122  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0959  hypothetical protein  45.11 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1037  hypothetical protein  50.86 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0637557  normal  0.475125 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3065  hypothetical protein  47.37 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840147  normal  0.26406 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2841  hypothetical protein  46.62 
 
 		 158 aa  120  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00554  Thioesterase (4HBT) superfamily enzyme  47.01 
 
 		 153 aa  120  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3850  hypothetical protein  46.62 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207149  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3041  hypothetical protein  44.78 
 
 		 158 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1205  hypothetical protein  44.78 
 
 		 163 aa  115  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1293  hypothetical protein  42.54 
 
 		 166 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.792696 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3226  hypothetical protein  42.54 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3074  hypothetical protein  42.54 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3083  hypothetical protein  42.54 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2976  hypothetical protein  43.28 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2880  hypothetical protein  43.28 
 
 		 164 aa  110  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2797  hypothetical protein  42.54 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0929  hypothetical protein  42.54 
 
 		 166 aa  107  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5832  hypothetical protein  45.19 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04700  hypothetical protein  41.03 
 
 		 157 aa  91.7  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3439  hypothetical protein  43.07 
 
 		 161 aa  87.8  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1399  hypothetical protein  48.78 
 
 		 109 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0892  hypothetical protein  44.79 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44213  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4134  hypothetical protein  31.93 
 
 		 166 aa  72  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.330749  normal  0.0332263 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4086  hypothetical protein  27.03 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0622  hypothetical protein  36 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3955  hypothetical protein  26.37 
 
 		 170 aa  44.3  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0785273  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1439  hypothetical protein  27.88 
 
 		 184 aa  43.9  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3475  hypothetical protein  25.84 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.21997  normal  0.540181 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2253  phenylacetic acid degradation-related protein  32.39 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.9321e-16  hitchhiker  0.00000000000000125506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2571  hypothetical protein  28.7 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30030  hypothetical protein  27.27 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0225  hypothetical protein  33.33 
 
 		 244 aa  40.8  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0251  hypothetical protein  26.19 
 
 		 238 aa  40.4  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.615513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>