46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3041 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_3041  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  330  5e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2841  hypothetical protein  81.01 
 
 
158 aa  269  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1205  hypothetical protein  79.62 
 
 
163 aa  264  4e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2880  hypothetical protein  80.52 
 
 
164 aa  263  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2797  hypothetical protein  79.87 
 
 
164 aa  263  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2976  hypothetical protein  79.87 
 
 
164 aa  262  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3083  hypothetical protein  78.57 
 
 
166 aa  261  4e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3226  hypothetical protein  78.57 
 
 
166 aa  261  4e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1293  hypothetical protein  77.92 
 
 
166 aa  259  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.792696 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3074  hypothetical protein  77.92 
 
 
166 aa  258  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0929  hypothetical protein  79.62 
 
 
166 aa  255  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2784  hypothetical protein  76.62 
 
 
158 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1106  hypothetical protein  74.68 
 
 
159 aa  250  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1037  hypothetical protein  74.68 
 
 
158 aa  248  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0637557  normal  0.475125 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0959  hypothetical protein  74.19 
 
 
158 aa  246  7e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4932  hypothetical protein  74.34 
 
 
156 aa  240  7e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00554  Thioesterase (4HBT) superfamily enzyme  63.09 
 
 
153 aa  196  7.999999999999999e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1399  hypothetical protein  74.76 
 
 
109 aa  169  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3850  hypothetical protein  50 
 
 
154 aa  166  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3537  phenylacetic acid degradation-like protein  40.69 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2388  thioesterase (4HBT) superfamily protein  45.38 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0659  hypothetical protein  45.38 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0806  hypothetical protein  45.38 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1177  thioesterase  45.38 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1101  hypothetical protein  45.38 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1770  hypothetical protein  45.38 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3460  hypothetical protein  41.89 
 
 
143 aa  123  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40800  hypothetical protein  44.78 
 
 
145 aa  121  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04700  hypothetical protein  37.91 
 
 
157 aa  121  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3439  hypothetical protein  42.11 
 
 
161 aa  120  9e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1599  hypothetical protein  43.08 
 
 
145 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3065  hypothetical protein  42.67 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840147  normal  0.26406 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2528  hypothetical protein  44.78 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.320049  normal  0.260243 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5832  hypothetical protein  37.58 
 
 
160 aa  114  5e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0892  hypothetical protein  32.47 
 
 
157 aa  100  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44213  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4134  hypothetical protein  32 
 
 
166 aa  91.7  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.330749  normal  0.0332263 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3955  hypothetical protein  28.14 
 
 
170 aa  58.5  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0785273  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0622  hypothetical protein  28.67 
 
 
162 aa  55.1  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1398  hypothetical protein  86.67 
 
 
30 aa  54.7  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2032  hypothetical protein  30.08 
 
 
230 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0251  hypothetical protein  34.41 
 
 
238 aa  52.4  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.615513 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0225  hypothetical protein  32.26 
 
 
244 aa  50.4  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30030  hypothetical protein  27.13 
 
 
184 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2571  hypothetical protein  28.83 
 
 
171 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3475  hypothetical protein  26.35 
 
 
173 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.21997  normal  0.540181 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4086  hypothetical protein  24.54 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>