51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0622 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_0622  hypothetical protein  100 
 
 
162 aa  336  7e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3955  hypothetical protein  46.79 
 
 
170 aa  161  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0785273  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2571  hypothetical protein  46.3 
 
 
171 aa  158  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30030  hypothetical protein  46.91 
 
 
184 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3475  hypothetical protein  47.13 
 
 
173 aa  150  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.21997  normal  0.540181 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4086  hypothetical protein  42.31 
 
 
173 aa  140  7e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2032  hypothetical protein  40.61 
 
 
230 aa  130  7.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0225  hypothetical protein  41.46 
 
 
244 aa  123  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0251  hypothetical protein  40.85 
 
 
238 aa  121  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.615513 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4134  hypothetical protein  26.06 
 
 
166 aa  64.7  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.330749  normal  0.0332263 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3065  hypothetical protein  29.45 
 
 
155 aa  63.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840147  normal  0.26406 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5294  hypothetical protein  35.25 
 
 
155 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5195  hypothetical protein  30.07 
 
 
154 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0603598  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3041  hypothetical protein  28.67 
 
 
158 aa  55.1  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0304  hypothetical protein  27.78 
 
 
148 aa  54.3  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3850  hypothetical protein  27.18 
 
 
154 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207149  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1599  hypothetical protein  30.28 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2841  hypothetical protein  31.68 
 
 
158 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66450  hypothetical protein  33.71 
 
 
150 aa  52  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5763  hypothetical protein  33.71 
 
 
150 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40800  hypothetical protein  36.92 
 
 
145 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3460  hypothetical protein  36.92 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0555  hypothetical protein  33.71 
 
 
147 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129509 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0959  hypothetical protein  36.76 
 
 
158 aa  48.5  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1770  hypothetical protein  26.61 
 
 
145 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0659  hypothetical protein  26.61 
 
 
145 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2388  thioesterase (4HBT) superfamily protein  26.61 
 
 
145 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2784  hypothetical protein  24.62 
 
 
158 aa  47.8  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0806  hypothetical protein  26.61 
 
 
145 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1101  hypothetical protein  26.61 
 
 
145 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1177  thioesterase  26.61 
 
 
145 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00554  Thioesterase (4HBT) superfamily enzyme  29.79 
 
 
153 aa  47.8  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1106  hypothetical protein  27.5 
 
 
159 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3537  phenylacetic acid degradation-like protein  31.82 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3074  hypothetical protein  32.61 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0892  hypothetical protein  31.91 
 
 
157 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44213  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1293  hypothetical protein  31.52 
 
 
166 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.792696 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2528  hypothetical protein  36 
 
 
145 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.320049  normal  0.260243 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3439  hypothetical protein  29.59 
 
 
161 aa  44.7  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2797  hypothetical protein  30.43 
 
 
164 aa  43.9  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3226  hypothetical protein  31.52 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2880  hypothetical protein  30.43 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3083  hypothetical protein  31.52 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2976  hypothetical protein  30.43 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0436  hypothetical protein  29.31 
 
 
143 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0929  hypothetical protein  28.18 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1037  hypothetical protein  27.19 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0637557  normal  0.475125 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1205  hypothetical protein  29.35 
 
 
163 aa  42.4  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04700  hypothetical protein  22.33 
 
 
157 aa  41.6  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0523  hypothetical protein  29.31 
 
 
154 aa  40.8  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680982  hitchhiker  0.005662 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02356  hypothetical protein  27.97 
 
 
163 aa  40.8  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>