19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2935 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2935  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  366  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0628257 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3957  hypothetical protein  46.85 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00692243  normal  0.0358268 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2401  phenylacetic acid degradation-related protein  31.78 
 
 		 148 aa  49.3  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.203664  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0304  hypothetical protein  32.69 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2032  hypothetical protein  31.37 
 
 		 230 aa  45.4  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0085  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  45.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.623619  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  32.05 
 
 		 157 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  29.03 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2571  hypothetical protein  29.1 
 
 		 171 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1498  thioesterase superfamily protein  26.43 
 
 		 149 aa  42.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3475  hypothetical protein  25.19 
 
 		 173 aa  42.4  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.21997  normal  0.540181 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4553  hypothetical protein  33.02 
 
 		 154 aa  42.4  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4086  hypothetical protein  28.17 
 
 		 173 aa  41.6  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5763  hypothetical protein  27.81 
 
 		 150 aa  41.2  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40800  hypothetical protein  31.58 
 
 		 145 aa  41.2  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66450  hypothetical protein  26.71 
 
 		 150 aa  41.2  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0599  hypothetical protein  27.45 
 
 		 160 aa  40.8  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.524334 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3460  hypothetical protein  31.58 
 
 		 143 aa  40.8  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30030  hypothetical protein  27.21 
 
 		 184 aa  40.8  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>