50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0225 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0225  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  498  1e-140  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0251  hypothetical protein  94.4 
 
 		 238 aa  452  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.615513 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2032  hypothetical protein  71.91 
 
 		 230 aa  276  1e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0622  hypothetical protein  41.46 
 
 		 162 aa  123  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3955  hypothetical protein  36.88 
 
 		 170 aa  115  6.9999999999999995e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0785273  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4086  hypothetical protein  37.89 
 
 		 173 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2571  hypothetical protein  34.78 
 
 		 171 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30030  hypothetical protein  33.14 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3475  hypothetical protein  34.38 
 
 		 173 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.21997  normal  0.540181 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4134  hypothetical protein  31.01 
 
 		 166 aa  77.8  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.330749  normal  0.0332263 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5195  hypothetical protein  31.11 
 
 		 154 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0603598  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0892  hypothetical protein  29.41 
 
 		 157 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44213  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3850  hypothetical protein  28.92 
 
 		 154 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207149  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0929  hypothetical protein  26.71 
 
 		 166 aa  50.4  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3041  hypothetical protein  32.26 
 
 		 158 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1037  hypothetical protein  26.32 
 
 		 158 aa  49.3  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0637557  normal  0.475125 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2797  hypothetical protein  27.08 
 
 		 164 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1293  hypothetical protein  26.49 
 
 		 166 aa  48.5  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.792696 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00554  Thioesterase (4HBT) superfamily enzyme  30.77 
 
 		 153 aa  48.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3226  hypothetical protein  26.49 
 
 		 166 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3074  hypothetical protein  26.49 
 
 		 166 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66450  hypothetical protein  33.01 
 
 		 150 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2880  hypothetical protein  27.08 
 
 		 164 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3083  hypothetical protein  26.49 
 
 		 166 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3065  hypothetical protein  29.82 
 
 		 155 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840147  normal  0.26406 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2976  hypothetical protein  26.39 
 
 		 164 aa  46.6  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40800  hypothetical protein  26.27 
 
 		 145 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2841  hypothetical protein  25.81 
 
 		 158 aa  45.8  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0959  hypothetical protein  25.18 
 
 		 158 aa  46.2  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0304  hypothetical protein  30.69 
 
 		 148 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2784  hypothetical protein  24.63 
 
 		 158 aa  45.8  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3439  hypothetical protein  28.46 
 
 		 161 aa  45.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5832  hypothetical protein  27.68 
 
 		 160 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1205  hypothetical protein  25.87 
 
 		 163 aa  45.4  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3460  hypothetical protein  26.27 
 
 		 143 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5763  hypothetical protein  33.01 
 
 		 150 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3537  phenylacetic acid degradation-like protein  23.44 
 
 		 146 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1599  hypothetical protein  22.48 
 
 		 145 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1106  hypothetical protein  24.44 
 
 		 159 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0659  hypothetical protein  21.71 
 
 		 145 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0430  thioesterase superfamily protein  30.59 
 
 		 155 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5294  hypothetical protein  30.93 
 
 		 155 aa  43.9  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1770  hypothetical protein  21.71 
 
 		 145 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1101  hypothetical protein  21.71 
 
 		 145 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1177  thioesterase  21.71 
 
 		 145 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0806  hypothetical protein  21.71 
 
 		 145 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2388  thioesterase (4HBT) superfamily protein  21.71 
 
 		 145 aa  43.5  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3101  thioesterase superfamily protein  27.47 
 
 		 162 aa  42.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0436  hypothetical protein  40 
 
 		 143 aa  42  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3305  phenylacetic acid degradation-related protein  29.33 
 
 		 209 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>