20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5195 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5195  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  310  5.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0603598  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5294  hypothetical protein  59.03 
 
 
155 aa  165  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0523  hypothetical protein  54.05 
 
 
154 aa  136  8.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680982  hitchhiker  0.005662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0304  hypothetical protein  45.27 
 
 
148 aa  130  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0436  hypothetical protein  51.39 
 
 
143 aa  130  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0085  hypothetical protein  39.57 
 
 
151 aa  101  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.623619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30030  hypothetical protein  35.56 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3955  hypothetical protein  31.91 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0785273  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2571  hypothetical protein  32.84 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3475  hypothetical protein  35.42 
 
 
173 aa  60.8  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.21997  normal  0.540181 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0622  hypothetical protein  30.07 
 
 
162 aa  59.7  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4086  hypothetical protein  29.37 
 
 
173 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4134  hypothetical protein  34 
 
 
166 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.330749  normal  0.0332263 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2032  hypothetical protein  29.93 
 
 
230 aa  54.7  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0251  hypothetical protein  31.85 
 
 
238 aa  52  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.615513 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0225  hypothetical protein  31.11 
 
 
244 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5763  hypothetical protein  31.13 
 
 
150 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66450  hypothetical protein  30.19 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0555  hypothetical protein  30.48 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129509 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3460  hypothetical protein  30.84 
 
 
143 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>