32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5763 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5763  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  300  5.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66450  hypothetical protein  94.67 
 
 
150 aa  288  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0555  hypothetical protein  75.86 
 
 
147 aa  224  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129509 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1439  hypothetical protein  45.38 
 
 
184 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5294  hypothetical protein  31.39 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0436  hypothetical protein  33.04 
 
 
143 aa  54.3  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2917  hypothetical protein  26.32 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.389629  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0622  hypothetical protein  33.71 
 
 
162 aa  51.2  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5195  hypothetical protein  31.13 
 
 
154 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0603598  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4086  hypothetical protein  33.33 
 
 
173 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0523  hypothetical protein  29.36 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680982  hitchhiker  0.005662 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1855  hypothetical protein  25.53 
 
 
164 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790822  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1327  hypothetical protein  24.41 
 
 
162 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0225  hypothetical protein  33.01 
 
 
244 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3955  hypothetical protein  31.11 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0785273  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0085  hypothetical protein  31.13 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.623619  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2158  thioesterase, putative  31.18 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2571  hypothetical protein  30 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1324  thioesterase domain-containing protein  26.04 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.317856  normal  0.994205 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0251  hypothetical protein  31.07 
 
 
238 aa  42.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.615513 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30030  hypothetical protein  28.89 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5832  hypothetical protein  27.54 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1791  thioesterase domain protein  31.46 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0304  hypothetical protein  27.14 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1001  thioesterase superfamily protein  26.28 
 
 
137 aa  41.6  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2935  hypothetical protein  27.81 
 
 
180 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0628257 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3164  phenylacetic acid degradation protein PaaD  29.85 
 
 
146 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000726933  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1720  thioesterase domain protein  30.34 
 
 
151 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0960141  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1137  hypothetical protein  25.25 
 
 
153 aa  40.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0090  hypothetical protein  22.58 
 
 
176 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2032  hypothetical protein  33.01 
 
 
230 aa  40.4  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0286  hypothetical protein  26.77 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>