21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0304 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0304  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  291  1e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0523  hypothetical protein  54.61 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680982  hitchhiker  0.005662 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5294  hypothetical protein  50 
 
 		 155 aa  144  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0436  hypothetical protein  58.04 
 
 		 143 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5195  hypothetical protein  45.27 
 
 		 154 aa  130  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0603598  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0085  hypothetical protein  38.13 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.623619  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4086  hypothetical protein  33.58 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3475  hypothetical protein  33.33 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.21997  normal  0.540181 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3955  hypothetical protein  31.16 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0785273  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2571  hypothetical protein  31.88 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30030  hypothetical protein  33.83 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0622  hypothetical protein  27.78 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4134  hypothetical protein  32.09 
 
 		 166 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.330749  normal  0.0332263 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0225  hypothetical protein  30.69 
 
 		 244 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2935  hypothetical protein  32.69 
 
 		 180 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0628257 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0251  hypothetical protein  30.69 
 
 		 238 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.615513 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2032  hypothetical protein  30.69 
 
 		 230 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5763  hypothetical protein  27.14 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66450  hypothetical protein  27.78 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3065  hypothetical protein  28.47 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840147  normal  0.26406 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0555  hypothetical protein  25.9 
 
 		 147 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000129509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>