32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3475 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3475  hypothetical protein  100 
 
 		 173 aa  357  4e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.21997  normal  0.540181 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3955  hypothetical protein  84.47 
 
 		 170 aa  290  7e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0785273  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4086  hypothetical protein  62.72 
 
 		 173 aa  227  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0622  hypothetical protein  47.13 
 
 		 162 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2571  hypothetical protein  44.44 
 
 		 171 aa  134  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30030  hypothetical protein  44.44 
 
 		 184 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2032  hypothetical protein  33.33 
 
 		 230 aa  102  2e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0225  hypothetical protein  34.38 
 
 		 244 aa  101  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0251  hypothetical protein  34.38 
 
 		 238 aa  99  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.615513 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5294  hypothetical protein  34.07 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0304  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4134  hypothetical protein  31.11 
 
 		 166 aa  61.6  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.330749  normal  0.0332263 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5195  hypothetical protein  35.42 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0603598  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3065  hypothetical protein  32.46 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840147  normal  0.26406 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0436  hypothetical protein  33.81 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0523  hypothetical protein  33.81 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680982  hitchhiker  0.005662 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2841  hypothetical protein  24.5 
 
 		 158 aa  48.9  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2784  hypothetical protein  25 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3041  hypothetical protein  26.35 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0892  hypothetical protein  26.71 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44213  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5230  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 157 aa  44.7  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317352  normal  0.57709 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0959  hypothetical protein  23.65 
 
 		 158 aa  44.7  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0929  hypothetical protein  24.68 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2528  hypothetical protein  25.84 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.320049  normal  0.260243 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1106  hypothetical protein  25 
 
 		 159 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3460  hypothetical protein  27.71 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5832  hypothetical protein  26.17 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3850  hypothetical protein  25.77 
 
 		 154 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40800  hypothetical protein  27.71 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2935  hypothetical protein  25.19 
 
 		 180 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0628257 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3439  hypothetical protein  32.63 
 
 		 161 aa  41.2  0.007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1037  hypothetical protein  22.3 
 
 		 158 aa  41.2  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0637557  normal  0.475125 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>