46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4086 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4086  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  352  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3955  hypothetical protein  65.62 
 
 
170 aa  236  2e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0785273  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3475  hypothetical protein  62.72 
 
 
173 aa  227  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.21997  normal  0.540181 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0622  hypothetical protein  42.31 
 
 
162 aa  140  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2571  hypothetical protein  47.17 
 
 
171 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30030  hypothetical protein  50.79 
 
 
184 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2032  hypothetical protein  39.1 
 
 
230 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0225  hypothetical protein  37.89 
 
 
244 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0251  hypothetical protein  37.89 
 
 
238 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.615513 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5294  hypothetical protein  33.58 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0436  hypothetical protein  34.53 
 
 
143 aa  67.8  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0523  hypothetical protein  34.53 
 
 
154 aa  67.8  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680982  hitchhiker  0.005662 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0304  hypothetical protein  33.58 
 
 
148 aa  65.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4134  hypothetical protein  32.17 
 
 
166 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.330749  normal  0.0332263 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0085  hypothetical protein  32.59 
 
 
151 aa  59.7  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.623619  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5195  hypothetical protein  29.37 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0603598  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1106  hypothetical protein  25.77 
 
 
159 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5832  hypothetical protein  29.37 
 
 
160 aa  52  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66450  hypothetical protein  31.16 
 
 
150 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3065  hypothetical protein  30.16 
 
 
155 aa  51.6  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840147  normal  0.26406 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2841  hypothetical protein  25.68 
 
 
158 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5763  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2784  hypothetical protein  26.38 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3850  hypothetical protein  28.57 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40800  hypothetical protein  32.38 
 
 
145 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1037  hypothetical protein  26.06 
 
 
158 aa  48.1  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0637557  normal  0.475125 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1599  hypothetical protein  29.46 
 
 
145 aa  47.8  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0659  hypothetical protein  29.46 
 
 
145 aa  47.4  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2388  thioesterase (4HBT) superfamily protein  29.46 
 
 
145 aa  47.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1770  hypothetical protein  29.46 
 
 
145 aa  47.4  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1101  hypothetical protein  29.46 
 
 
145 aa  47.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1177  thioesterase  29.46 
 
 
145 aa  47.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0806  hypothetical protein  29.46 
 
 
145 aa  47.4  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3460  hypothetical protein  31.43 
 
 
143 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0892  hypothetical protein  30.22 
 
 
157 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44213  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2528  hypothetical protein  27.03 
 
 
145 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.320049  normal  0.260243 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3439  hypothetical protein  29.23 
 
 
161 aa  45.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3041  hypothetical protein  24.54 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04700  hypothetical protein  27.82 
 
 
157 aa  43.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0454  hypothetical protein  33.96 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0959  hypothetical protein  24.29 
 
 
158 aa  42  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0555  hypothetical protein  31.67 
 
 
147 aa  41.6  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2935  hypothetical protein  28.17 
 
 
180 aa  41.6  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0628257 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00554  Thioesterase (4HBT) superfamily enzyme  26.87 
 
 
153 aa  41.2  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3537  phenylacetic acid degradation-like protein  26.79 
 
 
146 aa  41.6  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1439  hypothetical protein  27.38 
 
 
184 aa  41.2  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>