45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2388 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008835  BMA10229_0806  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0659  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2388  thioesterase (4HBT) superfamily protein  100 
 
 
145 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1770  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1101  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1177  thioesterase  100 
 
 
145 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1599  hypothetical protein  93.1 
 
 
145 aa  286  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3537  phenylacetic acid degradation-like protein  71.53 
 
 
146 aa  224  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2528  hypothetical protein  60.84 
 
 
145 aa  176  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.320049  normal  0.260243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3460  hypothetical protein  60.14 
 
 
143 aa  170  5e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40800  hypothetical protein  60.9 
 
 
145 aa  165  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5832  hypothetical protein  50 
 
 
160 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2784  hypothetical protein  46.15 
 
 
158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1106  hypothetical protein  42.76 
 
 
159 aa  126  8.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3065  hypothetical protein  48.87 
 
 
155 aa  125  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840147  normal  0.26406 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3041  hypothetical protein  45.38 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1037  hypothetical protein  40.27 
 
 
158 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0637557  normal  0.475125 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2841  hypothetical protein  41.38 
 
 
158 aa  121  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2880  hypothetical protein  40 
 
 
164 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0929  hypothetical protein  39.31 
 
 
166 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2797  hypothetical protein  40 
 
 
164 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1293  hypothetical protein  38.62 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.792696 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1205  hypothetical protein  40 
 
 
163 aa  118  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3083  hypothetical protein  38.62 
 
 
166 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3074  hypothetical protein  38.62 
 
 
166 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3226  hypothetical protein  38.62 
 
 
166 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2976  hypothetical protein  39.31 
 
 
164 aa  117  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4932  hypothetical protein  38.62 
 
 
156 aa  116  9e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0959  hypothetical protein  43.08 
 
 
158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3850  hypothetical protein  43.18 
 
 
154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207149  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00554  Thioesterase (4HBT) superfamily enzyme  37.93 
 
 
153 aa  110  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04700  hypothetical protein  38.24 
 
 
157 aa  97.4  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4134  hypothetical protein  38.17 
 
 
166 aa  94.4  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.330749  normal  0.0332263 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3439  hypothetical protein  40.6 
 
 
161 aa  92.4  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1399  hypothetical protein  40.82 
 
 
109 aa  89  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0892  hypothetical protein  37.78 
 
 
157 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44213  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2571  hypothetical protein  30.63 
 
 
171 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30030  hypothetical protein  30.63 
 
 
184 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2032  hypothetical protein  23.36 
 
 
230 aa  47.8  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0622  hypothetical protein  26.61 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4086  hypothetical protein  29.46 
 
 
173 aa  47.4  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1094  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0251  hypothetical protein  23.26 
 
 
238 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.615513 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1439  hypothetical protein  29.52 
 
 
184 aa  43.9  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0225  hypothetical protein  21.71 
 
 
244 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>