47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3537 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3537  phenylacetic acid degradation-like protein  100 
 
 
146 aa  305  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.27561 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0659  hypothetical protein  71.53 
 
 
145 aa  224  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2388  thioesterase (4HBT) superfamily protein  71.53 
 
 
145 aa  224  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0806  hypothetical protein  71.53 
 
 
145 aa  224  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1770  hypothetical protein  71.53 
 
 
145 aa  224  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1177  thioesterase  71.53 
 
 
145 aa  224  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1101  hypothetical protein  71.53 
 
 
145 aa  224  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.8491  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1599  hypothetical protein  70.83 
 
 
145 aa  221  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2528  hypothetical protein  60.14 
 
 
145 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.320049  normal  0.260243 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3460  hypothetical protein  60.43 
 
 
143 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.63147  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40800  hypothetical protein  63.91 
 
 
145 aa  168  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5832  hypothetical protein  54.07 
 
 
160 aa  141  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2784  hypothetical protein  44.44 
 
 
158 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3041  hypothetical protein  40.69 
 
 
158 aa  126  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1205  hypothetical protein  46.15 
 
 
163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0929  hypothetical protein  40.69 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1106  hypothetical protein  41.38 
 
 
159 aa  124  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3074  hypothetical protein  44.62 
 
 
166 aa  122  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0959  hypothetical protein  44.85 
 
 
158 aa  122  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.893116  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2976  hypothetical protein  45.38 
 
 
164 aa  122  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2880  hypothetical protein  45.38 
 
 
164 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1037  hypothetical protein  43.18 
 
 
158 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0637557  normal  0.475125 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2797  hypothetical protein  45.38 
 
 
164 aa  122  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1293  hypothetical protein  43.85 
 
 
166 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.792696 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3226  hypothetical protein  43.85 
 
 
166 aa  120  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3065  hypothetical protein  44.22 
 
 
155 aa  121  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.840147  normal  0.26406 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3083  hypothetical protein  43.85 
 
 
166 aa  120  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2841  hypothetical protein  39.33 
 
 
158 aa  120  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3850  hypothetical protein  45.86 
 
 
154 aa  120  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.207149  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00554  Thioesterase (4HBT) superfamily enzyme  41.55 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4932  hypothetical protein  39.31 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3439  hypothetical protein  45.26 
 
 
161 aa  110  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04700  hypothetical protein  38.13 
 
 
157 aa  95.1  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1399  hypothetical protein  48.19 
 
 
109 aa  94  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4134  hypothetical protein  36.64 
 
 
166 aa  86.7  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.330749  normal  0.0332263 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0892  hypothetical protein  37.16 
 
 
157 aa  86.3  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.44213  normal  0.640114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2571  hypothetical protein  29.2 
 
 
171 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30030  hypothetical protein  30.48 
 
 
184 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0251  hypothetical protein  25.58 
 
 
238 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.615513 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0622  hypothetical protein  31.82 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0225  hypothetical protein  23.44 
 
 
244 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2032  hypothetical protein  23.44 
 
 
230 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.488451  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4161  hypothetical protein  30.12 
 
 
167 aa  43.5  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.434521  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4019  hypothetical protein  29.82 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1439  hypothetical protein  35.23 
 
 
184 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4135  hypothetical protein  30.12 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0420248  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4086  hypothetical protein  26.79 
 
 
173 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>