18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0523 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0523  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  304  2.0000000000000002e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680982  hitchhiker  0.005662 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0436  hypothetical protein  87.41 
 
 
143 aa  236  6.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5294  hypothetical protein  55.1 
 
 
155 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0304  hypothetical protein  54.61 
 
 
148 aa  156  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5195  hypothetical protein  53.69 
 
 
154 aa  152  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0603598  normal  0.873958 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0085  hypothetical protein  43.45 
 
 
151 aa  110  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.623619  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4086  hypothetical protein  35.25 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3955  hypothetical protein  33.81 
 
 
170 aa  65.5  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0785273  normal  0.998705 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3475  hypothetical protein  34.53 
 
 
173 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.21997  normal  0.540181 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66450  hypothetical protein  31.36 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5763  hypothetical protein  31.25 
 
 
150 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0555  hypothetical protein  28.57 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000129509 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2571  hypothetical protein  31.3 
 
 
171 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30030  hypothetical protein  32.17 
 
 
184 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0622  hypothetical protein  28.21 
 
 
162 aa  44.3  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  35.24 
 
 
154 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0357  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0251  hypothetical protein  30.19 
 
 
238 aa  40  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.615513 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>